Protein–RNA interactions for Protein: Q86YS3

RAB11FIP4, Rab11 family-interacting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 637 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP4Q86YS3 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAB11FIP4Q86YS3 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAB11FIP4Q86YS3 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAB11FIP4Q86YS3 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAB11FIP4Q86YS3 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAB11FIP4Q86YS3 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAB11FIP4Q86YS3 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAB11FIP4Q86YS3 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAB11FIP4Q86YS3 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAB11FIP4Q86YS3 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAB11FIP4Q86YS3 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAB11FIP4Q86YS3 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAB11FIP4Q86YS3 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAB11FIP4Q86YS3 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAB11FIP4Q86YS3 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAB11FIP4Q86YS3 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAB11FIP4Q86YS3 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAB11FIP4Q86YS3 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAB11FIP4Q86YS3 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAB11FIP4Q86YS3 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAB11FIP4Q86YS3 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAB11FIP4Q86YS3 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAB11FIP4Q86YS3 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
RAB11FIP4Q86YS3 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAB11FIP4Q86YS3 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAB11FIP4Q86YS3 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAB11FIP4Q86YS3 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAB11FIP4Q86YS3 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAB11FIP4Q86YS3 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
RAB11FIP4Q86YS3 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
RAB11FIP4Q86YS3 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAB11FIP4Q86YS3 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAB11FIP4Q86YS3 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAB11FIP4Q86YS3 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAB11FIP4Q86YS3 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAB11FIP4Q86YS3 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAB11FIP4Q86YS3 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAB11FIP4Q86YS3 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAB11FIP4Q86YS3 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAB11FIP4Q86YS3 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAB11FIP4Q86YS3 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAB11FIP4Q86YS3 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAB11FIP4Q86YS3 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAB11FIP4Q86YS3 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAB11FIP4Q86YS3 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAB11FIP4Q86YS3 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAB11FIP4Q86YS3 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAB11FIP4Q86YS3 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAB11FIP4Q86YS3 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAB11FIP4Q86YS3 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAB11FIP4Q86YS3 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAB11FIP4Q86YS3 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAB11FIP4Q86YS3 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAB11FIP4Q86YS3 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAB11FIP4Q86YS3 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAB11FIP4Q86YS3 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAB11FIP4Q86YS3 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAB11FIP4Q86YS3 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAB11FIP4Q86YS3 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAB11FIP4Q86YS3 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAB11FIP4Q86YS3 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAB11FIP4Q86YS3 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAB11FIP4Q86YS3 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAB11FIP4Q86YS3 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAB11FIP4Q86YS3 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAB11FIP4Q86YS3 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAB11FIP4Q86YS3 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAB11FIP4Q86YS3 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
RAB11FIP4Q86YS3 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
RAB11FIP4Q86YS3 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAB11FIP4Q86YS3 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAB11FIP4Q86YS3 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAB11FIP4Q86YS3 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAB11FIP4Q86YS3 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
RAB11FIP4Q86YS3 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
RAB11FIP4Q86YS3 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAB11FIP4Q86YS3 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAB11FIP4Q86YS3 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAB11FIP4Q86YS3 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAB11FIP4Q86YS3 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAB11FIP4Q86YS3 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAB11FIP4Q86YS3 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAB11FIP4Q86YS3 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAB11FIP4Q86YS3 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAB11FIP4Q86YS3 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAB11FIP4Q86YS3 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAB11FIP4Q86YS3 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAB11FIP4Q86YS3 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAB11FIP4Q86YS3 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAB11FIP4Q86YS3 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAB11FIP4Q86YS3 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RAB11FIP4Q86YS3 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
RAB11FIP4Q86YS3 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RAB11FIP4Q86YS3 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RAB11FIP4Q86YS3 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RAB11FIP4Q86YS3 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RAB11FIP4Q86YS3 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
RAB11FIP4Q86YS3 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RAB11FIP4Q86YS3 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RAB11FIP4Q86YS3 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms