Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTM1

OTOP1, Otopetrin-1, humanhuman

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTOP1Q7RTM1 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
OTOP1Q7RTM1 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
OTOP1Q7RTM1 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
OTOP1Q7RTM1 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
OTOP1Q7RTM1 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
OTOP1Q7RTM1 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
OTOP1Q7RTM1 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
OTOP1Q7RTM1 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
OTOP1Q7RTM1 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
OTOP1Q7RTM1 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
OTOP1Q7RTM1 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
OTOP1Q7RTM1 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
OTOP1Q7RTM1 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
OTOP1Q7RTM1 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
OTOP1Q7RTM1 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
OTOP1Q7RTM1 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
OTOP1Q7RTM1 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
OTOP1Q7RTM1 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
OTOP1Q7RTM1 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
OTOP1Q7RTM1 SAP25-201ENST00000538735 837 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
OTOP1Q7RTM1 PSORS1C1-206ENST00000547221 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
OTOP1Q7RTM1 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
OTOP1Q7RTM1 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
OTOP1Q7RTM1 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
OTOP1Q7RTM1 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
OTOP1Q7RTM1 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
OTOP1Q7RTM1 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
OTOP1Q7RTM1 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
OTOP1Q7RTM1 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
OTOP1Q7RTM1 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
OTOP1Q7RTM1 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
OTOP1Q7RTM1 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
OTOP1Q7RTM1 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
OTOP1Q7RTM1 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
OTOP1Q7RTM1 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
OTOP1Q7RTM1 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
OTOP1Q7RTM1 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
OTOP1Q7RTM1 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
OTOP1Q7RTM1 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
OTOP1Q7RTM1 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
OTOP1Q7RTM1 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
OTOP1Q7RTM1 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
OTOP1Q7RTM1 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
OTOP1Q7RTM1 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
OTOP1Q7RTM1 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
OTOP1Q7RTM1 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
OTOP1Q7RTM1 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
OTOP1Q7RTM1 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
OTOP1Q7RTM1 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
OTOP1Q7RTM1 PON3-201ENST00000265627 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
OTOP1Q7RTM1 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
OTOP1Q7RTM1 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
OTOP1Q7RTM1 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
OTOP1Q7RTM1 AIMP2-202ENST00000395236 860 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
OTOP1Q7RTM1 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
OTOP1Q7RTM1 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
OTOP1Q7RTM1 AC079807.2-203ENST00000417692 656 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
OTOP1Q7RTM1 AC243961.1-201ENST00000432559 384 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
OTOP1Q7RTM1 AC245056.1-201ENST00000437631 384 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
OTOP1Q7RTM1 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
OTOP1Q7RTM1 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
OTOP1Q7RTM1 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
OTOP1Q7RTM1 EIF3K-202ENST00000538434 966 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
OTOP1Q7RTM1 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
OTOP1Q7RTM1 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
OTOP1Q7RTM1 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
OTOP1Q7RTM1 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
OTOP1Q7RTM1 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
OTOP1Q7RTM1 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
OTOP1Q7RTM1 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
OTOP1Q7RTM1 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
OTOP1Q7RTM1 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
OTOP1Q7RTM1 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
OTOP1Q7RTM1 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
OTOP1Q7RTM1 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
OTOP1Q7RTM1 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
OTOP1Q7RTM1 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
OTOP1Q7RTM1 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
OTOP1Q7RTM1 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
OTOP1Q7RTM1 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
OTOP1Q7RTM1 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
OTOP1Q7RTM1 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
OTOP1Q7RTM1 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
OTOP1Q7RTM1 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
OTOP1Q7RTM1 ANK1-203ENST00000314214 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
OTOP1Q7RTM1 IL27-201ENST00000356897 1044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
OTOP1Q7RTM1 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
OTOP1Q7RTM1 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
OTOP1Q7RTM1 LY6E-208ENST00000520531 490 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
OTOP1Q7RTM1 LINC01475-201ENST00000548010 766 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
OTOP1Q7RTM1 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
OTOP1Q7RTM1 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
OTOP1Q7RTM1 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
OTOP1Q7RTM1 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
OTOP1Q7RTM1 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
OTOP1Q7RTM1 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
OTOP1Q7RTM1 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
OTOP1Q7RTM1 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
OTOP1Q7RTM1 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
OTOP1Q7RTM1 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms