Protein–RNA interactions for Protein: Q76G19

PDZD4, PDZ domain-containing protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 769 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZD4Q76G19 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PDZD4Q76G19 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PDZD4Q76G19 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PDZD4Q76G19 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PDZD4Q76G19 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PDZD4Q76G19 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PDZD4Q76G19 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PDZD4Q76G19 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PDZD4Q76G19 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PDZD4Q76G19 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PDZD4Q76G19 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PDZD4Q76G19 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PDZD4Q76G19 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PDZD4Q76G19 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PDZD4Q76G19 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PDZD4Q76G19 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PDZD4Q76G19 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PDZD4Q76G19 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PDZD4Q76G19 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PDZD4Q76G19 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PDZD4Q76G19 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PDZD4Q76G19 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PDZD4Q76G19 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PDZD4Q76G19 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PDZD4Q76G19 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PDZD4Q76G19 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PDZD4Q76G19 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PDZD4Q76G19 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PDZD4Q76G19 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PDZD4Q76G19 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PDZD4Q76G19 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PDZD4Q76G19 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PDZD4Q76G19 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PDZD4Q76G19 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PDZD4Q76G19 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PDZD4Q76G19 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PDZD4Q76G19 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PDZD4Q76G19 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PDZD4Q76G19 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PDZD4Q76G19 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PDZD4Q76G19 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PDZD4Q76G19 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PDZD4Q76G19 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PDZD4Q76G19 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PDZD4Q76G19 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PDZD4Q76G19 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PDZD4Q76G19 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PDZD4Q76G19 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PDZD4Q76G19 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PDZD4Q76G19 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PDZD4Q76G19 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PDZD4Q76G19 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PDZD4Q76G19 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PDZD4Q76G19 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PDZD4Q76G19 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PDZD4Q76G19 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PDZD4Q76G19 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PDZD4Q76G19 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PDZD4Q76G19 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PDZD4Q76G19 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PDZD4Q76G19 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PDZD4Q76G19 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PDZD4Q76G19 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PDZD4Q76G19 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PDZD4Q76G19 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PDZD4Q76G19 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PDZD4Q76G19 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PDZD4Q76G19 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PDZD4Q76G19 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PDZD4Q76G19 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PDZD4Q76G19 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PDZD4Q76G19 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PDZD4Q76G19 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PDZD4Q76G19 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PDZD4Q76G19 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PDZD4Q76G19 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PDZD4Q76G19 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PDZD4Q76G19 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PDZD4Q76G19 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PDZD4Q76G19 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PDZD4Q76G19 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PDZD4Q76G19 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PDZD4Q76G19 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PDZD4Q76G19 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PDZD4Q76G19 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PDZD4Q76G19 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PDZD4Q76G19 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PDZD4Q76G19 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PDZD4Q76G19 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PDZD4Q76G19 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PDZD4Q76G19 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PDZD4Q76G19 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PDZD4Q76G19 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PDZD4Q76G19 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PDZD4Q76G19 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PDZD4Q76G19 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PDZD4Q76G19 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PDZD4Q76G19 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PDZD4Q76G19 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PDZD4Q76G19 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms