Protein–RNA interactions for Protein: Q70EL4

USP43, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 43, humanhuman

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Length 1,123 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP43Q70EL4 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
USP43Q70EL4 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
USP43Q70EL4 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
USP43Q70EL4 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
USP43Q70EL4 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
USP43Q70EL4 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC14.22□□□□□ -0.13
USP43Q70EL4 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
USP43Q70EL4 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
USP43Q70EL4 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
USP43Q70EL4 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
USP43Q70EL4 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
USP43Q70EL4 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
USP43Q70EL4 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
USP43Q70EL4 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
USP43Q70EL4 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
USP43Q70EL4 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
USP43Q70EL4 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
USP43Q70EL4 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
USP43Q70EL4 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
USP43Q70EL4 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
USP43Q70EL4 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
USP43Q70EL4 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
USP43Q70EL4 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
USP43Q70EL4 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
USP43Q70EL4 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
USP43Q70EL4 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
USP43Q70EL4 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
USP43Q70EL4 PLK2-201ENST00000274289 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
USP43Q70EL4 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
USP43Q70EL4 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
USP43Q70EL4 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
USP43Q70EL4 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
USP43Q70EL4 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
USP43Q70EL4 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
USP43Q70EL4 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
USP43Q70EL4 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
USP43Q70EL4 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
USP43Q70EL4 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
USP43Q70EL4 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
USP43Q70EL4 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
USP43Q70EL4 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
USP43Q70EL4 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
USP43Q70EL4 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
USP43Q70EL4 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
USP43Q70EL4 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
USP43Q70EL4 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
USP43Q70EL4 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
USP43Q70EL4 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
USP43Q70EL4 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
USP43Q70EL4 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
USP43Q70EL4 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC14.21□□□□□ -0.13
USP43Q70EL4 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
USP43Q70EL4 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.21□□□□□ -0.13
USP43Q70EL4 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.13
USP43Q70EL4 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
USP43Q70EL4 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
USP43Q70EL4 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
USP43Q70EL4 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
USP43Q70EL4 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
USP43Q70EL4 OFD1-202ENST00000380550 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
USP43Q70EL4 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
USP43Q70EL4 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
USP43Q70EL4 GALC-206ENST00000544807 2528 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
USP43Q70EL4 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
USP43Q70EL4 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
USP43Q70EL4 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
USP43Q70EL4 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
USP43Q70EL4 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
USP43Q70EL4 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.14
USP43Q70EL4 ALDH3A2-226ENST00000631291 3822 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
USP43Q70EL4 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
USP43Q70EL4 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.14
USP43Q70EL4 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
USP43Q70EL4 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
USP43Q70EL4 DBN1-203ENST00000393565 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
USP43Q70EL4 FAM219A-203ENST00000379080 3591 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.14
USP43Q70EL4 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
USP43Q70EL4 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
USP43Q70EL4 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
USP43Q70EL4 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
USP43Q70EL4 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
USP43Q70EL4 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
USP43Q70EL4 SPIN3-204ENST00000638257 4835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
USP43Q70EL4 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
USP43Q70EL4 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
USP43Q70EL4 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
USP43Q70EL4 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
USP43Q70EL4 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
USP43Q70EL4 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
USP43Q70EL4 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
USP43Q70EL4 TAS1R3-201ENST00000339381 3433 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
USP43Q70EL4 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
USP43Q70EL4 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
USP43Q70EL4 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
USP43Q70EL4 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
USP43Q70EL4 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
USP43Q70EL4 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
USP43Q70EL4 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
USP43Q70EL4 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
USP43Q70EL4 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
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