Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ2

USP34, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 34, humanhuman

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Length 3,546 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP34Q70CQ2 PPIE-202ENST00000356511 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
USP34Q70CQ2 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
USP34Q70CQ2 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
USP34Q70CQ2 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
USP34Q70CQ2 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
USP34Q70CQ2 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
USP34Q70CQ2 AC109460.1-201ENST00000567209 1478 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
USP34Q70CQ2 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
USP34Q70CQ2 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
USP34Q70CQ2 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
USP34Q70CQ2 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
USP34Q70CQ2 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
USP34Q70CQ2 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
USP34Q70CQ2 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
USP34Q70CQ2 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
USP34Q70CQ2 AL357563.1-201ENST00000404728 395 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
USP34Q70CQ2 SOX9-AS1-207ENST00000446332 443 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
USP34Q70CQ2 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
USP34Q70CQ2 AC134312.2-201ENST00000563521 608 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
USP34Q70CQ2 FAM104A-206ENST00000583024 417 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
USP34Q70CQ2 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
USP34Q70CQ2 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
USP34Q70CQ2 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
USP34Q70CQ2 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
USP34Q70CQ2 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
USP34Q70CQ2 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
USP34Q70CQ2 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
USP34Q70CQ2 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
USP34Q70CQ2 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
USP34Q70CQ2 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
USP34Q70CQ2 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
USP34Q70CQ2 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
USP34Q70CQ2 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
USP34Q70CQ2 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
USP34Q70CQ2 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
USP34Q70CQ2 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
USP34Q70CQ2 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
USP34Q70CQ2 SLC25A19-205ENST00000442286 1496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
USP34Q70CQ2 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
USP34Q70CQ2 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
USP34Q70CQ2 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
USP34Q70CQ2 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
USP34Q70CQ2 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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USP34Q70CQ2 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
USP34Q70CQ2 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
USP34Q70CQ2 HIST1H2AE-201ENST00000303910 509 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
USP34Q70CQ2 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
USP34Q70CQ2 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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USP34Q70CQ2 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
USP34Q70CQ2 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
USP34Q70CQ2 KLK6-201ENST00000310157 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
USP34Q70CQ2 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
USP34Q70CQ2 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
USP34Q70CQ2 IL23A-201ENST00000228534 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
USP34Q70CQ2 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
USP34Q70CQ2 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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USP34Q70CQ2 AC233724.6-201ENST00000503184 1088 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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USP34Q70CQ2 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
USP34Q70CQ2 SNX11-210ENST00000582104 1282 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
USP34Q70CQ2 AC008758.6-201ENST00000598753 588 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
USP34Q70CQ2 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
USP34Q70CQ2 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
USP34Q70CQ2 OARD1-203ENST00000463088 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
USP34Q70CQ2 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
USP34Q70CQ2 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
USP34Q70CQ2 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
USP34Q70CQ2 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
USP34Q70CQ2 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
USP34Q70CQ2 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
USP34Q70CQ2 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
USP34Q70CQ2 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
USP34Q70CQ2 AC145207.8-201ENST00000580897 563 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
USP34Q70CQ2 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
USP34Q70CQ2 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
USP34Q70CQ2 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
USP34Q70CQ2 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
USP34Q70CQ2 CRYBB1-201ENST00000215939 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
USP34Q70CQ2 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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