Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSB3

LINC00299, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00299, humanhuman

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Length 139 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00299Q6ZSB3 SIRT5-203ENST00000379262 2339 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LINC00299Q6ZSB3 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LINC00299Q6ZSB3 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
LINC00299Q6ZSB3 SAFB-211ENST00000592224 3014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LINC00299Q6ZSB3 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
LINC00299Q6ZSB3 EBLN3P-202ENST00000625445 4520 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LINC00299Q6ZSB3 SYBU-235ENST00000533895 3244 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LINC00299Q6ZSB3 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LINC00299Q6ZSB3 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
LINC00299Q6ZSB3 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
LINC00299Q6ZSB3 SPATA20-227ENST00000634597 2587 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
LINC00299Q6ZSB3 SLC4A7-213ENST00000454389 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LINC00299Q6ZSB3 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LINC00299Q6ZSB3 ARHGEF4-217ENST00000611048 3486 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
LINC00299Q6ZSB3 COG5-202ENST00000347053 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LINC00299Q6ZSB3 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LINC00299Q6ZSB3 C7orf65-201ENST00000408988 2911 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
LINC00299Q6ZSB3 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LINC00299Q6ZSB3 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LINC00299Q6ZSB3 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LINC00299Q6ZSB3 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LINC00299Q6ZSB3 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LINC00299Q6ZSB3 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LINC00299Q6ZSB3 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
LINC00299Q6ZSB3 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
LINC00299Q6ZSB3 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
LINC00299Q6ZSB3 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC13.53□□□□□ -0.24
LINC00299Q6ZSB3 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
LINC00299Q6ZSB3 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
LINC00299Q6ZSB3 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
LINC00299Q6ZSB3 TOR1AIP1-201ENST00000271583 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
LINC00299Q6ZSB3 TUBGCP6-201ENST00000248846 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LINC00299Q6ZSB3 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
LINC00299Q6ZSB3 ARHGAP10-201ENST00000336498 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LINC00299Q6ZSB3 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LINC00299Q6ZSB3 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
LINC00299Q6ZSB3 POM121L14P-201ENST00000406100 1558 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
LINC00299Q6ZSB3 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LINC00299Q6ZSB3 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
LINC00299Q6ZSB3 TGM1-201ENST00000206765 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LINC00299Q6ZSB3 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
LINC00299Q6ZSB3 TMEM100-201ENST00000424486 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LINC00299Q6ZSB3 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
LINC00299Q6ZSB3 MDM1-201ENST00000303145 2918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LINC00299Q6ZSB3 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
LINC00299Q6ZSB3 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
LINC00299Q6ZSB3 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
LINC00299Q6ZSB3 CCT7-201ENST00000258091 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
LINC00299Q6ZSB3 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
LINC00299Q6ZSB3 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
LINC00299Q6ZSB3 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
LINC00299Q6ZSB3 PJA1-203ENST00000374583 2692 ntAPPRIS P4 BASIC13.52□□□□□ -0.24
LINC00299Q6ZSB3 PIAS1-202ENST00000545237 2932 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
LINC00299Q6ZSB3 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
LINC00299Q6ZSB3 FIBCD1-202ENST00000372338 3253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
LINC00299Q6ZSB3 TMPRSS12-202ENST00000551456 3336 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
LINC00299Q6ZSB3 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
LINC00299Q6ZSB3 ZBTB7B-202ENST00000368426 3594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
LINC00299Q6ZSB3 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
LINC00299Q6ZSB3 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
LINC00299Q6ZSB3 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
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LINC00299Q6ZSB3 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
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LINC00299Q6ZSB3 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
LINC00299Q6ZSB3 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
LINC00299Q6ZSB3 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
LINC00299Q6ZSB3 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
LINC00299Q6ZSB3 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
LINC00299Q6ZSB3 SVOPL-202ENST00000419765 1523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
LINC00299Q6ZSB3 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
LINC00299Q6ZSB3 EVC2-201ENST00000310917 4828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
LINC00299Q6ZSB3 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
LINC00299Q6ZSB3 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
LINC00299Q6ZSB3 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
LINC00299Q6ZSB3 SLC2A14-213ENST00000539924 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
LINC00299Q6ZSB3 MAP3K3-203ENST00000577395 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
LINC00299Q6ZSB3 MBP-208ENST00000397866 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
LINC00299Q6ZSB3 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
LINC00299Q6ZSB3 RXRG-204ENST00000619224 2252 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
LINC00299Q6ZSB3 CLCN4-201ENST00000380829 2418 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
LINC00299Q6ZSB3 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
LINC00299Q6ZSB3 C19orf44-203ENST00000594035 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
LINC00299Q6ZSB3 PCTP-207ENST00000576183 2680 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
LINC00299Q6ZSB3 LGALS9-201ENST00000302228 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
LINC00299Q6ZSB3 TRMT2B-203ENST00000372939 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
LINC00299Q6ZSB3 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
LINC00299Q6ZSB3 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
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