Protein–RNA interactions for Protein: Q676U5

ATG16L1, Autophagy-related protein 16-1, humanhuman

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L1Q676U5 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATG16L1Q676U5 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATG16L1Q676U5 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATG16L1Q676U5 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATG16L1Q676U5 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATG16L1Q676U5 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATG16L1Q676U5 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATG16L1Q676U5 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ATG16L1Q676U5 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATG16L1Q676U5 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATG16L1Q676U5 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATG16L1Q676U5 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATG16L1Q676U5 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATG16L1Q676U5 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATG16L1Q676U5 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATG16L1Q676U5 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATG16L1Q676U5 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATG16L1Q676U5 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATG16L1Q676U5 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATG16L1Q676U5 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATG16L1Q676U5 AC097374.1-201ENST00000568768 6624 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATG16L1Q676U5 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATG16L1Q676U5 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ATG16L1Q676U5 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATG16L1Q676U5 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATG16L1Q676U5 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATG16L1Q676U5 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATG16L1Q676U5 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATG16L1Q676U5 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATG16L1Q676U5 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATG16L1Q676U5 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATG16L1Q676U5 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATG16L1Q676U5 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATG16L1Q676U5 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATG16L1Q676U5 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATG16L1Q676U5 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATG16L1Q676U5 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATG16L1Q676U5 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATG16L1Q676U5 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATG16L1Q676U5 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATG16L1Q676U5 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATG16L1Q676U5 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATG16L1Q676U5 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATG16L1Q676U5 ZNF618-201ENST00000288466 9109 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATG16L1Q676U5 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATG16L1Q676U5 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATG16L1Q676U5 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATG16L1Q676U5 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATG16L1Q676U5 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATG16L1Q676U5 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATG16L1Q676U5 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATG16L1Q676U5 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATG16L1Q676U5 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATG16L1Q676U5 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATG16L1Q676U5 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ATG16L1Q676U5 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ATG16L1Q676U5 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATG16L1Q676U5 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATG16L1Q676U5 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATG16L1Q676U5 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATG16L1Q676U5 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATG16L1Q676U5 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATG16L1Q676U5 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATG16L1Q676U5 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ATG16L1Q676U5 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATG16L1Q676U5 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATG16L1Q676U5 TRAF1-201ENST00000373887 6324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATG16L1Q676U5 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATG16L1Q676U5 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATG16L1Q676U5 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATG16L1Q676U5 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATG16L1Q676U5 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATG16L1Q676U5 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATG16L1Q676U5 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATG16L1Q676U5 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATG16L1Q676U5 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATG16L1Q676U5 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATG16L1Q676U5 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATG16L1Q676U5 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATG16L1Q676U5 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATG16L1Q676U5 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ATG16L1Q676U5 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATG16L1Q676U5 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATG16L1Q676U5 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATG16L1Q676U5 AKAP12-204ENST00000402676 8432 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATG16L1Q676U5 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATG16L1Q676U5 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATG16L1Q676U5 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATG16L1Q676U5 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATG16L1Q676U5 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATG16L1Q676U5 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATG16L1Q676U5 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATG16L1Q676U5 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATG16L1Q676U5 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ATG16L1Q676U5 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATG16L1Q676U5 YTHDF3-205ENST00000539294 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATG16L1Q676U5 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATG16L1Q676U5 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATG16L1Q676U5 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATG16L1Q676U5 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms