Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT33

LINC01545, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01545, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01545Q5VT33 FAM90A24P-201ENST00000520792 2369 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
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LINC01545Q5VT33 PHLDB2-204ENST00000431670 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
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LINC01545Q5VT33 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
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LINC01545Q5VT33 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
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