Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWW7

C10orf55, Uncharacterized protein C10orf55, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C10orf55Q5SWW7 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
C10orf55Q5SWW7 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
C10orf55Q5SWW7 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
C10orf55Q5SWW7 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
C10orf55Q5SWW7 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
C10orf55Q5SWW7 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
C10orf55Q5SWW7 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
C10orf55Q5SWW7 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
C10orf55Q5SWW7 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
C10orf55Q5SWW7 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
C10orf55Q5SWW7 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
C10orf55Q5SWW7 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
C10orf55Q5SWW7 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC12.43□□□□□ -0.42
C10orf55Q5SWW7 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
C10orf55Q5SWW7 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
C10orf55Q5SWW7 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
C10orf55Q5SWW7 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
C10orf55Q5SWW7 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
C10orf55Q5SWW7 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
C10orf55Q5SWW7 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
C10orf55Q5SWW7 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
C10orf55Q5SWW7 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
C10orf55Q5SWW7 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
C10orf55Q5SWW7 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
C10orf55Q5SWW7 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
C10orf55Q5SWW7 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
C10orf55Q5SWW7 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
C10orf55Q5SWW7 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
C10orf55Q5SWW7 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
C10orf55Q5SWW7 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
C10orf55Q5SWW7 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
C10orf55Q5SWW7 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
C10orf55Q5SWW7 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
C10orf55Q5SWW7 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
C10orf55Q5SWW7 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
C10orf55Q5SWW7 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
C10orf55Q5SWW7 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
C10orf55Q5SWW7 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
C10orf55Q5SWW7 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
C10orf55Q5SWW7 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
C10orf55Q5SWW7 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
C10orf55Q5SWW7 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
C10orf55Q5SWW7 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
C10orf55Q5SWW7 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
C10orf55Q5SWW7 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
C10orf55Q5SWW7 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
C10orf55Q5SWW7 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC12.42□□□□□ -0.42
C10orf55Q5SWW7 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
C10orf55Q5SWW7 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
C10orf55Q5SWW7 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
C10orf55Q5SWW7 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
C10orf55Q5SWW7 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
C10orf55Q5SWW7 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
C10orf55Q5SWW7 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
C10orf55Q5SWW7 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
C10orf55Q5SWW7 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
C10orf55Q5SWW7 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
C10orf55Q5SWW7 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
C10orf55Q5SWW7 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
C10orf55Q5SWW7 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
C10orf55Q5SWW7 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
C10orf55Q5SWW7 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
C10orf55Q5SWW7 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
C10orf55Q5SWW7 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
C10orf55Q5SWW7 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC12.42□□□□□ -0.42
C10orf55Q5SWW7 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
C10orf55Q5SWW7 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
C10orf55Q5SWW7 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
C10orf55Q5SWW7 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
C10orf55Q5SWW7 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
C10orf55Q5SWW7 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
C10orf55Q5SWW7 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
C10orf55Q5SWW7 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
C10orf55Q5SWW7 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
C10orf55Q5SWW7 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
C10orf55Q5SWW7 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
C10orf55Q5SWW7 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
C10orf55Q5SWW7 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
C10orf55Q5SWW7 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
C10orf55Q5SWW7 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
C10orf55Q5SWW7 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
C10orf55Q5SWW7 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
C10orf55Q5SWW7 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
C10orf55Q5SWW7 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
C10orf55Q5SWW7 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
C10orf55Q5SWW7 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
C10orf55Q5SWW7 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
C10orf55Q5SWW7 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
C10orf55Q5SWW7 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
C10orf55Q5SWW7 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
C10orf55Q5SWW7 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
C10orf55Q5SWW7 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
C10orf55Q5SWW7 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
C10orf55Q5SWW7 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
C10orf55Q5SWW7 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
C10orf55Q5SWW7 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
C10orf55Q5SWW7 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
C10orf55Q5SWW7 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
C10orf55Q5SWW7 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
C10orf55Q5SWW7 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms