Protein–RNA interactions for Protein: Q5JST6

EFHC2, EF-hand domain-containing family member C2, humanhuman

Predictions only

Length 749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFHC2Q5JST6 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EFHC2Q5JST6 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EFHC2Q5JST6 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EFHC2Q5JST6 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EFHC2Q5JST6 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EFHC2Q5JST6 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EFHC2Q5JST6 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EFHC2Q5JST6 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EFHC2Q5JST6 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EFHC2Q5JST6 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EFHC2Q5JST6 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EFHC2Q5JST6 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EFHC2Q5JST6 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EFHC2Q5JST6 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
EFHC2Q5JST6 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EFHC2Q5JST6 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EFHC2Q5JST6 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EFHC2Q5JST6 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EFHC2Q5JST6 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EFHC2Q5JST6 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
EFHC2Q5JST6 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EFHC2Q5JST6 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EFHC2Q5JST6 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EFHC2Q5JST6 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
EFHC2Q5JST6 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
EFHC2Q5JST6 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
EFHC2Q5JST6 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
EFHC2Q5JST6 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
EFHC2Q5JST6 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
EFHC2Q5JST6 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EFHC2Q5JST6 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EFHC2Q5JST6 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EFHC2Q5JST6 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EFHC2Q5JST6 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EFHC2Q5JST6 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EFHC2Q5JST6 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EFHC2Q5JST6 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
EFHC2Q5JST6 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
EFHC2Q5JST6 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
EFHC2Q5JST6 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
EFHC2Q5JST6 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
EFHC2Q5JST6 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EFHC2Q5JST6 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EFHC2Q5JST6 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EFHC2Q5JST6 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EFHC2Q5JST6 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EFHC2Q5JST6 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EFHC2Q5JST6 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EFHC2Q5JST6 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EFHC2Q5JST6 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EFHC2Q5JST6 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EFHC2Q5JST6 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
EFHC2Q5JST6 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EFHC2Q5JST6 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EFHC2Q5JST6 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EFHC2Q5JST6 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EFHC2Q5JST6 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EFHC2Q5JST6 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EFHC2Q5JST6 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EFHC2Q5JST6 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EFHC2Q5JST6 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EFHC2Q5JST6 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EFHC2Q5JST6 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EFHC2Q5JST6 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EFHC2Q5JST6 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EFHC2Q5JST6 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EFHC2Q5JST6 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EFHC2Q5JST6 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EFHC2Q5JST6 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EFHC2Q5JST6 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EFHC2Q5JST6 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EFHC2Q5JST6 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EFHC2Q5JST6 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EFHC2Q5JST6 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EFHC2Q5JST6 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EFHC2Q5JST6 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EFHC2Q5JST6 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EFHC2Q5JST6 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EFHC2Q5JST6 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EFHC2Q5JST6 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EFHC2Q5JST6 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EFHC2Q5JST6 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EFHC2Q5JST6 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EFHC2Q5JST6 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EFHC2Q5JST6 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EFHC2Q5JST6 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EFHC2Q5JST6 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EFHC2Q5JST6 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EFHC2Q5JST6 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EFHC2Q5JST6 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EFHC2Q5JST6 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EFHC2Q5JST6 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EFHC2Q5JST6 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EFHC2Q5JST6 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EFHC2Q5JST6 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EFHC2Q5JST6 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
EFHC2Q5JST6 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EFHC2Q5JST6 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EFHC2Q5JST6 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EFHC2Q5JST6 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms