Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI61

KRTAP20-2, Keratin-associated protein 20-2, humanhuman

Predictions only

Length 65 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP20-2Q3LI61 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
KRTAP20-2Q3LI61 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
KRTAP20-2Q3LI61 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
KRTAP20-2Q3LI61 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
KRTAP20-2Q3LI61 SLC6A9-207ENST00000475075 1881 ntTSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
KRTAP20-2Q3LI61 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
KRTAP20-2Q3LI61 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
KRTAP20-2Q3LI61 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
KRTAP20-2Q3LI61 MTMR9-202ENST00000526292 1960 ntTSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
KRTAP20-2Q3LI61 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
KRTAP20-2Q3LI61 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
KRTAP20-2Q3LI61 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
KRTAP20-2Q3LI61 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
KRTAP20-2Q3LI61 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
KRTAP20-2Q3LI61 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
KRTAP20-2Q3LI61 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
KRTAP20-2Q3LI61 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
KRTAP20-2Q3LI61 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
KRTAP20-2Q3LI61 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
KRTAP20-2Q3LI61 CRYGC-201ENST00000282141 629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
KRTAP20-2Q3LI61 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
KRTAP20-2Q3LI61 MRPS11-202ENST00000353598 766 ntTSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
KRTAP20-2Q3LI61 Metazoa_SRP.4-201ENST00000366232 298 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
KRTAP20-2Q3LI61 AC106827.1-201ENST00000366454 431 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
KRTAP20-2Q3LI61 DYNLT1-201ENST00000367085 774 ntTSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
KRTAP20-2Q3LI61 PRELID3B-202ENST00000371033 943 ntTSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
KRTAP20-2Q3LI61 TREM2-202ENST00000373113 1044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
KRTAP20-2Q3LI61 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
KRTAP20-2Q3LI61 PHACTR1-203ENST00000379335 943 ntTSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
KRTAP20-2Q3LI61 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
KRTAP20-2Q3LI61 ANG-202ENST00000397990 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
KRTAP20-2Q3LI61 CFAP36-203ENST00000403007 759 ntTSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
KRTAP20-2Q3LI61 GSTT2B-202ENST00000404172 819 ntTSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
KRTAP20-2Q3LI61 PPP1R7-205ENST00000404405 1009 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
KRTAP20-2Q3LI61 SAPCD1-208ENST00000415669 916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
KRTAP20-2Q3LI61 AL121983.2-202ENST00000419983 535 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
KRTAP20-2Q3LI61 CXorf40A-205ENST00000423540 1208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
KRTAP20-2Q3LI61 IGLV9-49-201ENST00000427632 409 ntAPPRIS P1 BASIC4.35□□□□□ -1.71
KRTAP20-2Q3LI61 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
KRTAP20-2Q3LI61 AL035413.1-201ENST00000437898 507 ntTSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
KRTAP20-2Q3LI61 UPK1A-AS1-201ENST00000443196 795 ntTSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
KRTAP20-2Q3LI61 VENTXP4-201ENST00000449029 958 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
KRTAP20-2Q3LI61 AL355803.1-201ENST00000455524 188 ntTSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
KRTAP20-2Q3LI61 MYL7-209ENST00000458240 791 ntTSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
KRTAP20-2Q3LI61 HFE-209ENST00000461397 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
KRTAP20-2Q3LI61 DMKN-229ENST00000467637 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
KRTAP20-2Q3LI61 RHEB-207ENST00000496004 744 ntTSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
KRTAP20-2Q3LI61 LINC02063-201ENST00000503415 566 ntTSL 4 BASIC4.35□□□□□ -1.71
KRTAP20-2Q3LI61 RHOH-206ENST00000505618 1225 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.35□□□□□ -1.71
KRTAP20-2Q3LI61 BCRP4-201ENST00000506079 804 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
KRTAP20-2Q3LI61 GLUD1P3-201ENST00000507952 896 ntTSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
KRTAP20-2Q3LI61 AC092612.1-201ENST00000514501 998 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
KRTAP20-2Q3LI61 CASP3-205ENST00000517513 964 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
KRTAP20-2Q3LI61 LINC00824-204ENST00000520766 597 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
KRTAP20-2Q3LI61 DHDDS-217ENST00000526219 1072 ntTSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
KRTAP20-2Q3LI61 OR5BD1P-201ENST00000532527 817 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
KRTAP20-2Q3LI61 AL162632.1-201ENST00000546784 548 ntTSL 4 BASIC4.35□□□□□ -1.71
KRTAP20-2Q3LI61 IFI27L1-212ENST00000557218 413 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
KRTAP20-2Q3LI61 AC012174.1-201ENST00000562349 714 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
KRTAP20-2Q3LI61 AC142086.5-202ENST00000562500 217 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
KRTAP20-2Q3LI61 CDIPT-AS1-202ENST00000565014 729 ntTSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
KRTAP20-2Q3LI61 AC009065.6-201ENST00000568795 456 ntTSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
KRTAP20-2Q3LI61 FBXO36P1-201ENST00000579006 471 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
KRTAP20-2Q3LI61 KRT17P4-206ENST00000584151 719 ntTSL 4 BASIC4.35□□□□□ -1.71
KRTAP20-2Q3LI61 APOC1-209ENST00000592885 562 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
KRTAP20-2Q3LI61 AC003006.1-202ENST00000594684 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
KRTAP20-2Q3LI61 SELENOW-212ENST00000601048 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
KRTAP20-2Q3LI61 DUSP22-213ENST00000605035 1231 ntTSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
KRTAP20-2Q3LI61 AL022334.2-201ENST00000610000 484 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
KRTAP20-2Q3LI61 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
KRTAP20-2Q3LI61 PHF23-213ENST00000613632 850 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
KRTAP20-2Q3LI61 AC004466.2-201ENST00000614749 516 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
KRTAP20-2Q3LI61 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
KRTAP20-2Q3LI61 AC090510.3-201ENST00000615831 821 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
KRTAP20-2Q3LI61 AL512324.3-201ENST00000619383 882 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
KRTAP20-2Q3LI61 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC4.35□□□□□ -1.71
KRTAP20-2Q3LI61 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
KRTAP20-2Q3LI61 AC129778.1-201ENST00000623957 920 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
KRTAP20-2Q3LI61 AC009145.4-201ENST00000625119 1294 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
KRTAP20-2Q3LI61 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
KRTAP20-2Q3LI61 IDH3A-224ENST00000629769 114 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
KRTAP20-2Q3LI61 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
KRTAP20-2Q3LI61 COQ3-201ENST00000254759 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
KRTAP20-2Q3LI61 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
KRTAP20-2Q3LI61 DHRS7-209ENST00000557185 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
KRTAP20-2Q3LI61 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
KRTAP20-2Q3LI61 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
KRTAP20-2Q3LI61 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
KRTAP20-2Q3LI61 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
KRTAP20-2Q3LI61 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
KRTAP20-2Q3LI61 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
KRTAP20-2Q3LI61 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
KRTAP20-2Q3LI61 VASH2-204ENST00000366966 1369 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
KRTAP20-2Q3LI61 AL109809.1-201ENST00000418979 1367 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
KRTAP20-2Q3LI61 MED7-202ENST00000420343 1382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
KRTAP20-2Q3LI61 SLC25A3-216ENST00000551917 1359 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
KRTAP20-2Q3LI61 DNMT3L-204ENST00000628202 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
KRTAP20-2Q3LI61 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
KRTAP20-2Q3LI61 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
KRTAP20-2Q3LI61 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.8 ms