Protein–RNA interactions for Protein: Q16740

CLPP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPPQ16740 TMEM200A-204ENST00000617887 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CLPPQ16740 NLRP13-201ENST00000342929 3132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CLPPQ16740 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CLPPQ16740 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CLPPQ16740 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CLPPQ16740 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CLPPQ16740 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CLPPQ16740 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CLPPQ16740 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CLPPQ16740 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CLPPQ16740 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CLPPQ16740 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CLPPQ16740 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CLPPQ16740 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CLPPQ16740 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CLPPQ16740 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CLPPQ16740 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CLPPQ16740 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CLPPQ16740 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
CLPPQ16740 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
CLPPQ16740 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
CLPPQ16740 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CLPPQ16740 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CLPPQ16740 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CLPPQ16740 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CLPPQ16740 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CLPPQ16740 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
CLPPQ16740 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CLPPQ16740 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CLPPQ16740 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
CLPPQ16740 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CLPPQ16740 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CLPPQ16740 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CLPPQ16740 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CLPPQ16740 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CLPPQ16740 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CLPPQ16740 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CLPPQ16740 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CLPPQ16740 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CLPPQ16740 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CLPPQ16740 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CLPPQ16740 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CLPPQ16740 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CLPPQ16740 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CLPPQ16740 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CLPPQ16740 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CLPPQ16740 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CLPPQ16740 SCARF1-201ENST00000263071 3443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CLPPQ16740 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CLPPQ16740 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CLPPQ16740 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CLPPQ16740 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CLPPQ16740 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CLPPQ16740 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CLPPQ16740 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CLPPQ16740 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
CLPPQ16740 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CLPPQ16740 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
CLPPQ16740 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CLPPQ16740 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CLPPQ16740 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CLPPQ16740 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CLPPQ16740 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CLPPQ16740 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CLPPQ16740 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CLPPQ16740 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CLPPQ16740 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CLPPQ16740 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CLPPQ16740 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CLPPQ16740 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CLPPQ16740 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CLPPQ16740 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CLPPQ16740 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
CLPPQ16740 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
CLPPQ16740 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
CLPPQ16740 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CLPPQ16740 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CLPPQ16740 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CLPPQ16740 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CLPPQ16740 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CLPPQ16740 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CLPPQ16740 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CLPPQ16740 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CLPPQ16740 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CLPPQ16740 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CLPPQ16740 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CLPPQ16740 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CLPPQ16740 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CLPPQ16740 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
CLPPQ16740 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CLPPQ16740 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CLPPQ16740 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CLPPQ16740 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CLPPQ16740 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CLPPQ16740 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CLPPQ16740 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CLPPQ16740 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CLPPQ16740 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CLPPQ16740 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CLPPQ16740 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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