Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
SGCBQ16585 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
SGCBQ16585 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC14.17□□□□□ -0.14
SGCBQ16585 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
SGCBQ16585 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
SGCBQ16585 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
SGCBQ16585 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
SGCBQ16585 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
SGCBQ16585 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
SGCBQ16585 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
SGCBQ16585 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
SGCBQ16585 MN1-201ENST00000302326 7556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
SGCBQ16585 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
SGCBQ16585 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
SGCBQ16585 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
SGCBQ16585 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
SGCBQ16585 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
SGCBQ16585 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
SGCBQ16585 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
SGCBQ16585 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
SGCBQ16585 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
SGCBQ16585 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
SGCBQ16585 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC14.17□□□□□ -0.14
SGCBQ16585 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC14.17□□□□□ -0.14
SGCBQ16585 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
SGCBQ16585 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC14.17□□□□□ -0.14
SGCBQ16585 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
SGCBQ16585 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
SGCBQ16585 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
SGCBQ16585 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
SGCBQ16585 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
SGCBQ16585 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
SGCBQ16585 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
SGCBQ16585 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
SGCBQ16585 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
SGCBQ16585 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
SGCBQ16585 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
SGCBQ16585 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
SGCBQ16585 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
SGCBQ16585 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
SGCBQ16585 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
SGCBQ16585 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
SGCBQ16585 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
SGCBQ16585 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
SGCBQ16585 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
SGCBQ16585 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
SGCBQ16585 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SGCBQ16585 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SGCBQ16585 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
SGCBQ16585 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SGCBQ16585 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
SGCBQ16585 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SGCBQ16585 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SGCBQ16585 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
SGCBQ16585 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SGCBQ16585 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SGCBQ16585 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
SGCBQ16585 AC097374.1-201ENST00000568768 6624 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SGCBQ16585 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
SGCBQ16585 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SGCBQ16585 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
SGCBQ16585 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SGCBQ16585 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
SGCBQ16585 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SGCBQ16585 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SGCBQ16585 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
SGCBQ16585 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SGCBQ16585 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SGCBQ16585 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SGCBQ16585 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SGCBQ16585 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SGCBQ16585 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SGCBQ16585 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SGCBQ16585 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
SGCBQ16585 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
SGCBQ16585 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
SGCBQ16585 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
SGCBQ16585 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
SGCBQ16585 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
SGCBQ16585 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
SGCBQ16585 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
SGCBQ16585 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
SGCBQ16585 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
SGCBQ16585 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
SGCBQ16585 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
SGCBQ16585 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
SGCBQ16585 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
SGCBQ16585 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
SGCBQ16585 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SGCBQ16585 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
SGCBQ16585 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SGCBQ16585 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
SGCBQ16585 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SGCBQ16585 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SGCBQ16585 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
SGCBQ16585 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
SGCBQ16585 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
SGCBQ16585 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SGCBQ16585 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SGCBQ16585 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms