Protein–RNA interactions for Protein: Q16533

SNAPC1, snRNA-activating protein complex subunit 1, humanhuman

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC1Q16533 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SNAPC1Q16533 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
SNAPC1Q16533 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
SNAPC1Q16533 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SNAPC1Q16533 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SNAPC1Q16533 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SNAPC1Q16533 KIAA0319-201ENST00000378214 6802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SNAPC1Q16533 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SNAPC1Q16533 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SNAPC1Q16533 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SNAPC1Q16533 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
SNAPC1Q16533 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SNAPC1Q16533 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SNAPC1Q16533 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SNAPC1Q16533 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
SNAPC1Q16533 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SNAPC1Q16533 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SNAPC1Q16533 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SNAPC1Q16533 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SNAPC1Q16533 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
SNAPC1Q16533 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SNAPC1Q16533 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SNAPC1Q16533 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
SNAPC1Q16533 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SNAPC1Q16533 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
SNAPC1Q16533 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SNAPC1Q16533 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
SNAPC1Q16533 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
SNAPC1Q16533 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
SNAPC1Q16533 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
SNAPC1Q16533 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SNAPC1Q16533 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
SNAPC1Q16533 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
SNAPC1Q16533 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
SNAPC1Q16533 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
SNAPC1Q16533 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SNAPC1Q16533 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SNAPC1Q16533 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
SNAPC1Q16533 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SNAPC1Q16533 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SNAPC1Q16533 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SNAPC1Q16533 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SNAPC1Q16533 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
SNAPC1Q16533 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SNAPC1Q16533 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SNAPC1Q16533 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
SNAPC1Q16533 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SNAPC1Q16533 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
SNAPC1Q16533 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SNAPC1Q16533 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
SNAPC1Q16533 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SNAPC1Q16533 GPN2-202ENST00000374135 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SNAPC1Q16533 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SNAPC1Q16533 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
SNAPC1Q16533 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SNAPC1Q16533 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
SNAPC1Q16533 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
SNAPC1Q16533 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
SNAPC1Q16533 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
SNAPC1Q16533 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
SNAPC1Q16533 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
SNAPC1Q16533 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
SNAPC1Q16533 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
SNAPC1Q16533 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
SNAPC1Q16533 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
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SNAPC1Q16533 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
SNAPC1Q16533 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
SNAPC1Q16533 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
SNAPC1Q16533 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
SNAPC1Q16533 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
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SNAPC1Q16533 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
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SNAPC1Q16533 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
SNAPC1Q16533 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
SNAPC1Q16533 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
SNAPC1Q16533 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
SNAPC1Q16533 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
SNAPC1Q16533 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
SNAPC1Q16533 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
SNAPC1Q16533 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
SNAPC1Q16533 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC14.17□□□□□ -0.14
SNAPC1Q16533 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
SNAPC1Q16533 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
SNAPC1Q16533 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC14.17□□□□□ -0.14
SNAPC1Q16533 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
SNAPC1Q16533 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
SNAPC1Q16533 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
SNAPC1Q16533 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
SNAPC1Q16533 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
SNAPC1Q16533 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
SNAPC1Q16533 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
SNAPC1Q16533 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
SNAPC1Q16533 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
SNAPC1Q16533 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
SNAPC1Q16533 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
SNAPC1Q16533 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
SNAPC1Q16533 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
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