Protein–RNA interactions for Protein: Q15904

ATP6AP1, V-type proton ATPase subunit S1, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6AP1Q15904 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
ATP6AP1Q15904 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
ATP6AP1Q15904 OPRL1-201ENST00000336866 3321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
ATP6AP1Q15904 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
ATP6AP1Q15904 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
ATP6AP1Q15904 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
ATP6AP1Q15904 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
ATP6AP1Q15904 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
ATP6AP1Q15904 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
ATP6AP1Q15904 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
ATP6AP1Q15904 POLL-205ENST00000370169 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
ATP6AP1Q15904 KIF6-203ENST00000394362 2394 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
ATP6AP1Q15904 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
ATP6AP1Q15904 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
ATP6AP1Q15904 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
ATP6AP1Q15904 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
ATP6AP1Q15904 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
ATP6AP1Q15904 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
ATP6AP1Q15904 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
ATP6AP1Q15904 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
ATP6AP1Q15904 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
ATP6AP1Q15904 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
ATP6AP1Q15904 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
ATP6AP1Q15904 NR1H3-221ENST00000481889 1704 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
ATP6AP1Q15904 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
ATP6AP1Q15904 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
ATP6AP1Q15904 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
ATP6AP1Q15904 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
ATP6AP1Q15904 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
ATP6AP1Q15904 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
ATP6AP1Q15904 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
ATP6AP1Q15904 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
ATP6AP1Q15904 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
ATP6AP1Q15904 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
ATP6AP1Q15904 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
ATP6AP1Q15904 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
ATP6AP1Q15904 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
ATP6AP1Q15904 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
ATP6AP1Q15904 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
ATP6AP1Q15904 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
ATP6AP1Q15904 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
ATP6AP1Q15904 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
ATP6AP1Q15904 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC14.44□□□□□ -0.1
ATP6AP1Q15904 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
ATP6AP1Q15904 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
ATP6AP1Q15904 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
ATP6AP1Q15904 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
ATP6AP1Q15904 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
ATP6AP1Q15904 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
ATP6AP1Q15904 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
ATP6AP1Q15904 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
ATP6AP1Q15904 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
ATP6AP1Q15904 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
ATP6AP1Q15904 SCYL1-205ENST00000524944 2715 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
ATP6AP1Q15904 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
ATP6AP1Q15904 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
ATP6AP1Q15904 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
ATP6AP1Q15904 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
ATP6AP1Q15904 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC14.44□□□□□ -0.1
ATP6AP1Q15904 SLFNL1-204ENST00000372613 2654 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
ATP6AP1Q15904 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
ATP6AP1Q15904 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
ATP6AP1Q15904 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
ATP6AP1Q15904 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
ATP6AP1Q15904 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
ATP6AP1Q15904 PITRM1-206ENST00000451104 3183 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
ATP6AP1Q15904 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
ATP6AP1Q15904 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
ATP6AP1Q15904 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
ATP6AP1Q15904 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
ATP6AP1Q15904 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
ATP6AP1Q15904 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
ATP6AP1Q15904 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
ATP6AP1Q15904 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
ATP6AP1Q15904 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
ATP6AP1Q15904 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
ATP6AP1Q15904 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC14.43□□□□□ -0.1
ATP6AP1Q15904 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
ATP6AP1Q15904 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
ATP6AP1Q15904 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
ATP6AP1Q15904 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
ATP6AP1Q15904 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
ATP6AP1Q15904 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
ATP6AP1Q15904 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC14.43□□□□□ -0.1
ATP6AP1Q15904 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
ATP6AP1Q15904 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
ATP6AP1Q15904 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
ATP6AP1Q15904 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
ATP6AP1Q15904 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
ATP6AP1Q15904 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
ATP6AP1Q15904 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
ATP6AP1Q15904 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
ATP6AP1Q15904 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
ATP6AP1Q15904 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
ATP6AP1Q15904 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
ATP6AP1Q15904 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
ATP6AP1Q15904 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
ATP6AP1Q15904 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
ATP6AP1Q15904 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
ATP6AP1Q15904 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.1 ms