Protein–RNA interactions for Protein: Q15788

NCOA1, Nuclear receptor coactivator 1, humanhuman

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Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA1Q15788 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NCOA1Q15788 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NCOA1Q15788 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NCOA1Q15788 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NCOA1Q15788 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
NCOA1Q15788 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NCOA1Q15788 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NCOA1Q15788 VPS29-201ENST00000360579 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NCOA1Q15788 PSMG4-203ENST00000380306 726 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NCOA1Q15788 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NCOA1Q15788 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NCOA1Q15788 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NCOA1Q15788 WSPAR-201ENST00000513561 683 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NCOA1Q15788 PTK2-225ENST00000520892 571 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NCOA1Q15788 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
NCOA1Q15788 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NCOA1Q15788 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
NCOA1Q15788 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NCOA1Q15788 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NCOA1Q15788 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NCOA1Q15788 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NCOA1Q15788 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NCOA1Q15788 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NCOA1Q15788 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NCOA1Q15788 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NCOA1Q15788 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NCOA1Q15788 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NCOA1Q15788 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NCOA1Q15788 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NCOA1Q15788 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
NCOA1Q15788 COMMD4-201ENST00000267935 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NCOA1Q15788 COMMD4-202ENST00000338995 722 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NCOA1Q15788 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NCOA1Q15788 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NCOA1Q15788 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NCOA1Q15788 LY6E-208ENST00000520531 490 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NCOA1Q15788 UBXN1-214ENST00000533000 367 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NCOA1Q15788 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NCOA1Q15788 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
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NCOA1Q15788 SAXO2-207ENST00000566861 404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
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NCOA1Q15788 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
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NCOA1Q15788 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NCOA1Q15788 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
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NCOA1Q15788 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
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NCOA1Q15788 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NCOA1Q15788 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NCOA1Q15788 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NCOA1Q15788 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NCOA1Q15788 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NCOA1Q15788 AC073316.1-202ENST00000402115 988 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NCOA1Q15788 EFCAB10-201ENST00000460135 717 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NCOA1Q15788 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NCOA1Q15788 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NCOA1Q15788 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NCOA1Q15788 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NCOA1Q15788 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
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