Protein–RNA interactions for Protein: Q15560

TCEA2, Transcription elongation factor A protein 2, humanhuman

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Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCEA2Q15560 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TCEA2Q15560 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TCEA2Q15560 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TCEA2Q15560 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TCEA2Q15560 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TCEA2Q15560 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TCEA2Q15560 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TCEA2Q15560 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TCEA2Q15560 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TCEA2Q15560 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TCEA2Q15560 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TCEA2Q15560 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TCEA2Q15560 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TCEA2Q15560 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TCEA2Q15560 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TCEA2Q15560 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TCEA2Q15560 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TCEA2Q15560 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TCEA2Q15560 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TCEA2Q15560 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TCEA2Q15560 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TCEA2Q15560 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TCEA2Q15560 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TCEA2Q15560 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TCEA2Q15560 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TCEA2Q15560 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TCEA2Q15560 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TCEA2Q15560 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TCEA2Q15560 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TCEA2Q15560 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TCEA2Q15560 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TCEA2Q15560 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TCEA2Q15560 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TCEA2Q15560 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TCEA2Q15560 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TCEA2Q15560 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TCEA2Q15560 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TCEA2Q15560 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TCEA2Q15560 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TCEA2Q15560 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TCEA2Q15560 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TCEA2Q15560 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TCEA2Q15560 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TCEA2Q15560 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TCEA2Q15560 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TCEA2Q15560 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TCEA2Q15560 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TCEA2Q15560 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TCEA2Q15560 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TCEA2Q15560 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TCEA2Q15560 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TCEA2Q15560 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TCEA2Q15560 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TCEA2Q15560 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TCEA2Q15560 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TCEA2Q15560 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TCEA2Q15560 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TCEA2Q15560 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TCEA2Q15560 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TCEA2Q15560 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TCEA2Q15560 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TCEA2Q15560 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TCEA2Q15560 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TCEA2Q15560 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
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TCEA2Q15560 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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TCEA2Q15560 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TCEA2Q15560 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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TCEA2Q15560 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TCEA2Q15560 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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TCEA2Q15560 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TCEA2Q15560 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TCEA2Q15560 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TCEA2Q15560 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TCEA2Q15560 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TCEA2Q15560 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TCEA2Q15560 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TCEA2Q15560 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
TCEA2Q15560 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
TCEA2Q15560 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TCEA2Q15560 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TCEA2Q15560 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TCEA2Q15560 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TCEA2Q15560 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
TCEA2Q15560 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
TCEA2Q15560 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TCEA2Q15560 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TCEA2Q15560 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TCEA2Q15560 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TCEA2Q15560 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TCEA2Q15560 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TCEA2Q15560 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TCEA2Q15560 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TCEA2Q15560 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TCEA2Q15560 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TCEA2Q15560 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
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