Protein–RNA interactions for Protein: Q15397

PUM3, Pumilio homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM3Q15397 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PUM3Q15397 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PUM3Q15397 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PUM3Q15397 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PUM3Q15397 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PUM3Q15397 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PUM3Q15397 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PUM3Q15397 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PUM3Q15397 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PUM3Q15397 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PUM3Q15397 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PUM3Q15397 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PUM3Q15397 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PUM3Q15397 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PUM3Q15397 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PUM3Q15397 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PUM3Q15397 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PUM3Q15397 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
PUM3Q15397 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PUM3Q15397 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PUM3Q15397 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
PUM3Q15397 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PUM3Q15397 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PUM3Q15397 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PUM3Q15397 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PUM3Q15397 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PUM3Q15397 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
PUM3Q15397 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
PUM3Q15397 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PUM3Q15397 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PUM3Q15397 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PUM3Q15397 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PUM3Q15397 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PUM3Q15397 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PUM3Q15397 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PUM3Q15397 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PUM3Q15397 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PUM3Q15397 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
PUM3Q15397 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PUM3Q15397 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PUM3Q15397 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PUM3Q15397 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PUM3Q15397 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PUM3Q15397 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PUM3Q15397 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PUM3Q15397 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PUM3Q15397 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PUM3Q15397 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PUM3Q15397 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PUM3Q15397 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PUM3Q15397 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PUM3Q15397 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PUM3Q15397 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PUM3Q15397 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PUM3Q15397 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PUM3Q15397 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PUM3Q15397 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PUM3Q15397 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PUM3Q15397 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PUM3Q15397 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PUM3Q15397 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PUM3Q15397 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PUM3Q15397 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PUM3Q15397 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PUM3Q15397 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PUM3Q15397 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PUM3Q15397 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PUM3Q15397 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PUM3Q15397 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PUM3Q15397 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PUM3Q15397 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PUM3Q15397 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
PUM3Q15397 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
PUM3Q15397 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PUM3Q15397 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PUM3Q15397 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PUM3Q15397 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PUM3Q15397 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
PUM3Q15397 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PUM3Q15397 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
PUM3Q15397 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PUM3Q15397 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PUM3Q15397 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
PUM3Q15397 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PUM3Q15397 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PUM3Q15397 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PUM3Q15397 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PUM3Q15397 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PUM3Q15397 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PUM3Q15397 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PUM3Q15397 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PUM3Q15397 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PUM3Q15397 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PUM3Q15397 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
PUM3Q15397 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PUM3Q15397 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PUM3Q15397 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PUM3Q15397 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PUM3Q15397 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PUM3Q15397 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
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