Protein–RNA interactions for Protein: Q15306

IRF4, Interferon regulatory factor 4, humanhuman

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Length 451 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF4Q15306 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
IRF4Q15306 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
IRF4Q15306 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
IRF4Q15306 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
IRF4Q15306 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
IRF4Q15306 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
IRF4Q15306 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
IRF4Q15306 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
IRF4Q15306 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
IRF4Q15306 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
IRF4Q15306 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
IRF4Q15306 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
IRF4Q15306 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
IRF4Q15306 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.02
IRF4Q15306 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
IRF4Q15306 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
IRF4Q15306 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IRF4Q15306 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IRF4Q15306 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IRF4Q15306 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IRF4Q15306 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IRF4Q15306 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IRF4Q15306 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IRF4Q15306 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IRF4Q15306 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IRF4Q15306 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IRF4Q15306 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IRF4Q15306 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IRF4Q15306 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IRF4Q15306 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IRF4Q15306 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IRF4Q15306 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IRF4Q15306 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
IRF4Q15306 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
IRF4Q15306 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IRF4Q15306 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
IRF4Q15306 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IRF4Q15306 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
IRF4Q15306 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IRF4Q15306 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
IRF4Q15306 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IRF4Q15306 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IRF4Q15306 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IRF4Q15306 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
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IRF4Q15306 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
IRF4Q15306 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IRF4Q15306 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IRF4Q15306 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
IRF4Q15306 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IRF4Q15306 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IRF4Q15306 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IRF4Q15306 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IRF4Q15306 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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IRF4Q15306 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IRF4Q15306 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IRF4Q15306 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IRF4Q15306 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IRF4Q15306 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IRF4Q15306 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IRF4Q15306 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IRF4Q15306 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IRF4Q15306 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IRF4Q15306 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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IRF4Q15306 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IRF4Q15306 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IRF4Q15306 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IRF4Q15306 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IRF4Q15306 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IRF4Q15306 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IRF4Q15306 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IRF4Q15306 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IRF4Q15306 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IRF4Q15306 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IRF4Q15306 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IRF4Q15306 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IRF4Q15306 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IRF4Q15306 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IRF4Q15306 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IRF4Q15306 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IRF4Q15306 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IRF4Q15306 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IRF4Q15306 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IRF4Q15306 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IRF4Q15306 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IRF4Q15306 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
IRF4Q15306 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
IRF4Q15306 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IRF4Q15306 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IRF4Q15306 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IRF4Q15306 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IRF4Q15306 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IRF4Q15306 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IRF4Q15306 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IRF4Q15306 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IRF4Q15306 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IRF4Q15306 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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