Protein–RNA interactions for Protein: Q14623

IHH, Indian hedgehog protein, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IHHQ14623 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IHHQ14623 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IHHQ14623 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IHHQ14623 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IHHQ14623 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IHHQ14623 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IHHQ14623 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IHHQ14623 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IHHQ14623 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IHHQ14623 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IHHQ14623 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IHHQ14623 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
IHHQ14623 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IHHQ14623 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IHHQ14623 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IHHQ14623 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IHHQ14623 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IHHQ14623 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IHHQ14623 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IHHQ14623 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IHHQ14623 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IHHQ14623 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IHHQ14623 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IHHQ14623 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
IHHQ14623 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
IHHQ14623 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IHHQ14623 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IHHQ14623 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IHHQ14623 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IHHQ14623 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IHHQ14623 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
IHHQ14623 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IHHQ14623 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IHHQ14623 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
IHHQ14623 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IHHQ14623 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IHHQ14623 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IHHQ14623 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IHHQ14623 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IHHQ14623 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IHHQ14623 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IHHQ14623 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IHHQ14623 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IHHQ14623 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IHHQ14623 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IHHQ14623 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IHHQ14623 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IHHQ14623 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IHHQ14623 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IHHQ14623 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IHHQ14623 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IHHQ14623 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IHHQ14623 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IHHQ14623 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IHHQ14623 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IHHQ14623 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IHHQ14623 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IHHQ14623 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IHHQ14623 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IHHQ14623 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IHHQ14623 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IHHQ14623 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IHHQ14623 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IHHQ14623 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IHHQ14623 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IHHQ14623 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IHHQ14623 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IHHQ14623 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IHHQ14623 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IHHQ14623 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IHHQ14623 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IHHQ14623 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IHHQ14623 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
IHHQ14623 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IHHQ14623 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IHHQ14623 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IHHQ14623 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IHHQ14623 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IHHQ14623 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IHHQ14623 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IHHQ14623 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IHHQ14623 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IHHQ14623 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IHHQ14623 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
IHHQ14623 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
IHHQ14623 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IHHQ14623 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IHHQ14623 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IHHQ14623 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IHHQ14623 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IHHQ14623 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IHHQ14623 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IHHQ14623 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IHHQ14623 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IHHQ14623 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IHHQ14623 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IHHQ14623 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IHHQ14623 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IHHQ14623 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IHHQ14623 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.1 ms