Protein–RNA interactions for Protein: Q14159

SPIDR, DNA repair-scaffolding protein, humanhuman

Predictions only

Length 915 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIDRQ14159 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPIDRQ14159 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPIDRQ14159 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPIDRQ14159 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPIDRQ14159 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPIDRQ14159 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPIDRQ14159 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPIDRQ14159 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPIDRQ14159 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPIDRQ14159 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPIDRQ14159 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPIDRQ14159 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPIDRQ14159 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPIDRQ14159 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPIDRQ14159 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPIDRQ14159 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPIDRQ14159 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPIDRQ14159 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SPIDRQ14159 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPIDRQ14159 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPIDRQ14159 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPIDRQ14159 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SPIDRQ14159 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPIDRQ14159 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPIDRQ14159 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPIDRQ14159 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPIDRQ14159 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPIDRQ14159 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPIDRQ14159 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SPIDRQ14159 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPIDRQ14159 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPIDRQ14159 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPIDRQ14159 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SPIDRQ14159 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPIDRQ14159 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPIDRQ14159 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPIDRQ14159 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPIDRQ14159 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPIDRQ14159 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPIDRQ14159 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPIDRQ14159 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPIDRQ14159 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPIDRQ14159 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPIDRQ14159 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPIDRQ14159 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SPIDRQ14159 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPIDRQ14159 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPIDRQ14159 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPIDRQ14159 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPIDRQ14159 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPIDRQ14159 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPIDRQ14159 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPIDRQ14159 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPIDRQ14159 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPIDRQ14159 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPIDRQ14159 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPIDRQ14159 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPIDRQ14159 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPIDRQ14159 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SPIDRQ14159 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPIDRQ14159 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SPIDRQ14159 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPIDRQ14159 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPIDRQ14159 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SPIDRQ14159 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPIDRQ14159 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPIDRQ14159 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPIDRQ14159 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPIDRQ14159 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPIDRQ14159 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPIDRQ14159 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPIDRQ14159 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPIDRQ14159 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPIDRQ14159 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPIDRQ14159 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPIDRQ14159 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SPIDRQ14159 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPIDRQ14159 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPIDRQ14159 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPIDRQ14159 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPIDRQ14159 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPIDRQ14159 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPIDRQ14159 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPIDRQ14159 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPIDRQ14159 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPIDRQ14159 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPIDRQ14159 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPIDRQ14159 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPIDRQ14159 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPIDRQ14159 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPIDRQ14159 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SPIDRQ14159 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SPIDRQ14159 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPIDRQ14159 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPIDRQ14159 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPIDRQ14159 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPIDRQ14159 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPIDRQ14159 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPIDRQ14159 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPIDRQ14159 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms