Protein–RNA interactions for Protein: Q14028

CNGB1, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB1Q14028 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CNGB1Q14028 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CNGB1Q14028 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CNGB1Q14028 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CNGB1Q14028 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CNGB1Q14028 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CNGB1Q14028 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CNGB1Q14028 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CNGB1Q14028 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CNGB1Q14028 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CNGB1Q14028 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CNGB1Q14028 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CNGB1Q14028 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CNGB1Q14028 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CNGB1Q14028 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CNGB1Q14028 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CNGB1Q14028 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CNGB1Q14028 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CNGB1Q14028 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CNGB1Q14028 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CNGB1Q14028 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CNGB1Q14028 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CNGB1Q14028 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CNGB1Q14028 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CNGB1Q14028 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CNGB1Q14028 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CNGB1Q14028 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CNGB1Q14028 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CNGB1Q14028 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CNGB1Q14028 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CNGB1Q14028 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CNGB1Q14028 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CNGB1Q14028 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CNGB1Q14028 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CNGB1Q14028 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CNGB1Q14028 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CNGB1Q14028 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CNGB1Q14028 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CNGB1Q14028 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CNGB1Q14028 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CNGB1Q14028 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CNGB1Q14028 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CNGB1Q14028 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CNGB1Q14028 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
CNGB1Q14028 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
CNGB1Q14028 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CNGB1Q14028 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CNGB1Q14028 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CNGB1Q14028 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CNGB1Q14028 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CNGB1Q14028 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CNGB1Q14028 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CNGB1Q14028 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CNGB1Q14028 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CNGB1Q14028 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CNGB1Q14028 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CNGB1Q14028 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CNGB1Q14028 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CNGB1Q14028 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CNGB1Q14028 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CNGB1Q14028 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CNGB1Q14028 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CNGB1Q14028 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CNGB1Q14028 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CNGB1Q14028 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CNGB1Q14028 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CNGB1Q14028 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CNGB1Q14028 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CNGB1Q14028 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CNGB1Q14028 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CNGB1Q14028 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CNGB1Q14028 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CNGB1Q14028 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CNGB1Q14028 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CNGB1Q14028 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CNGB1Q14028 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CNGB1Q14028 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CNGB1Q14028 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CNGB1Q14028 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CNGB1Q14028 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CNGB1Q14028 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CNGB1Q14028 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CNGB1Q14028 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CNGB1Q14028 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CNGB1Q14028 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CNGB1Q14028 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CNGB1Q14028 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CNGB1Q14028 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CNGB1Q14028 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CNGB1Q14028 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CNGB1Q14028 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CNGB1Q14028 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CNGB1Q14028 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CNGB1Q14028 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CNGB1Q14028 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CNGB1Q14028 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CNGB1Q14028 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CNGB1Q14028 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CNGB1Q14028 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CNGB1Q14028 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.8 ms