Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

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Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CACNA1SQ13698 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CACNA1SQ13698 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
CACNA1SQ13698 LINC01006-202ENST00000418309 640 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CACNA1SQ13698 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
CACNA1SQ13698 AC098935.1-201ENST00000446057 611 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
CACNA1SQ13698 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CACNA1SQ13698 ENDOV-229ENST00000523999 864 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CACNA1SQ13698 EIF3K-202ENST00000538434 966 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CACNA1SQ13698 WDR7-208ENST00000589935 544 ntTSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CACNA1SQ13698 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
CACNA1SQ13698 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CACNA1SQ13698 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CACNA1SQ13698 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CACNA1SQ13698 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CACNA1SQ13698 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CACNA1SQ13698 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CACNA1SQ13698 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CACNA1SQ13698 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CACNA1SQ13698 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CACNA1SQ13698 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CACNA1SQ13698 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CACNA1SQ13698 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CACNA1SQ13698 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CACNA1SQ13698 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CACNA1SQ13698 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CACNA1SQ13698 RBM4B-202ENST00000524637 867 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CACNA1SQ13698 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CACNA1SQ13698 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CACNA1SQ13698 AC138894.2-201ENST00000602838 371 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
CACNA1SQ13698 TBC1D3J-201ENST00000620719 1426 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
CACNA1SQ13698 AC007718.1-201ENST00000621078 280 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
CACNA1SQ13698 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CACNA1SQ13698 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CACNA1SQ13698 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
CACNA1SQ13698 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CACNA1SQ13698 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CACNA1SQ13698 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CACNA1SQ13698 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CACNA1SQ13698 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CACNA1SQ13698 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CACNA1SQ13698 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CACNA1SQ13698 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CACNA1SQ13698 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CACNA1SQ13698 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CACNA1SQ13698 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CACNA1SQ13698 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CACNA1SQ13698 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
CACNA1SQ13698 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CACNA1SQ13698 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CACNA1SQ13698 IL9-201ENST00000274520 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CACNA1SQ13698 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CACNA1SQ13698 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CACNA1SQ13698 PPDPF-202ENST00000370179 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CACNA1SQ13698 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CACNA1SQ13698 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CACNA1SQ13698 AC093151.3-202ENST00000445073 709 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CACNA1SQ13698 LY6E-208ENST00000520531 490 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CACNA1SQ13698 PSORS1C1-206ENST00000547221 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CACNA1SQ13698 SAXO2-207ENST00000566861 404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CACNA1SQ13698 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CACNA1SQ13698 MIR3147-201ENST00000577811 66 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CACNA1SQ13698 AC007881.3-201ENST00000608897 607 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CACNA1SQ13698 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CACNA1SQ13698 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CACNA1SQ13698 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CACNA1SQ13698 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CACNA1SQ13698 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CACNA1SQ13698 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CACNA1SQ13698 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CACNA1SQ13698 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CACNA1SQ13698 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CACNA1SQ13698 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CACNA1SQ13698 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CACNA1SQ13698 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CACNA1SQ13698 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CACNA1SQ13698 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CACNA1SQ13698 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CACNA1SQ13698 PIK3IP1-202ENST00000402249 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CACNA1SQ13698 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CACNA1SQ13698 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CACNA1SQ13698 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CACNA1SQ13698 AC019193.1-201ENST00000506678 823 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CACNA1SQ13698 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CACNA1SQ13698 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CACNA1SQ13698 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CACNA1SQ13698 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CACNA1SQ13698 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CACNA1SQ13698 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CACNA1SQ13698 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CACNA1SQ13698 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CACNA1SQ13698 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CACNA1SQ13698 SCGN-203ENST00000612225 1402 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CACNA1SQ13698 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CACNA1SQ13698 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CACNA1SQ13698 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CACNA1SQ13698 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CACNA1SQ13698 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CACNA1SQ13698 IGHV3-37-201ENST00000518544 340 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CACNA1SQ13698 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
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