Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
NEUROD1Q13562 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NEUROD1Q13562 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
NEUROD1Q13562 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NEUROD1Q13562 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NEUROD1Q13562 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NEUROD1Q13562 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NEUROD1Q13562 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NEUROD1Q13562 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NEUROD1Q13562 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NEUROD1Q13562 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NEUROD1Q13562 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NEUROD1Q13562 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NEUROD1Q13562 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NEUROD1Q13562 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NEUROD1Q13562 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NEUROD1Q13562 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NEUROD1Q13562 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
NEUROD1Q13562 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NEUROD1Q13562 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NEUROD1Q13562 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
NEUROD1Q13562 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NEUROD1Q13562 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
NEUROD1Q13562 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NEUROD1Q13562 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NEUROD1Q13562 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
NEUROD1Q13562 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NEUROD1Q13562 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NEUROD1Q13562 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NEUROD1Q13562 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NEUROD1Q13562 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NEUROD1Q13562 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NEUROD1Q13562 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NEUROD1Q13562 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NEUROD1Q13562 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NEUROD1Q13562 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NEUROD1Q13562 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
NEUROD1Q13562 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NEUROD1Q13562 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NEUROD1Q13562 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NEUROD1Q13562 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NEUROD1Q13562 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NEUROD1Q13562 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NEUROD1Q13562 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NEUROD1Q13562 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NEUROD1Q13562 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NEUROD1Q13562 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NEUROD1Q13562 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NEUROD1Q13562 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NEUROD1Q13562 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NEUROD1Q13562 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NEUROD1Q13562 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NEUROD1Q13562 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NEUROD1Q13562 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NEUROD1Q13562 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NEUROD1Q13562 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NEUROD1Q13562 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NEUROD1Q13562 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NEUROD1Q13562 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NEUROD1Q13562 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NEUROD1Q13562 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
NEUROD1Q13562 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NEUROD1Q13562 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
NEUROD1Q13562 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NEUROD1Q13562 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NEUROD1Q13562 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NEUROD1Q13562 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NEUROD1Q13562 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NEUROD1Q13562 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NEUROD1Q13562 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NEUROD1Q13562 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NEUROD1Q13562 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NEUROD1Q13562 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NEUROD1Q13562 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NEUROD1Q13562 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NEUROD1Q13562 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NEUROD1Q13562 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NEUROD1Q13562 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NEUROD1Q13562 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NEUROD1Q13562 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NEUROD1Q13562 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NEUROD1Q13562 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NEUROD1Q13562 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
NEUROD1Q13562 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NEUROD1Q13562 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NEUROD1Q13562 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NEUROD1Q13562 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NEUROD1Q13562 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NEUROD1Q13562 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NEUROD1Q13562 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NEUROD1Q13562 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NEUROD1Q13562 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NEUROD1Q13562 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NEUROD1Q13562 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NEUROD1Q13562 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NEUROD1Q13562 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NEUROD1Q13562 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NEUROD1Q13562 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NEUROD1Q13562 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NEUROD1Q13562 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
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