Protein–RNA interactions for Protein: Q13509

TUBB3, Tubulin beta-3 chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB3Q13509 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TUBB3Q13509 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TUBB3Q13509 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TUBB3Q13509 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TUBB3Q13509 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TUBB3Q13509 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TUBB3Q13509 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TUBB3Q13509 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TUBB3Q13509 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TUBB3Q13509 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TUBB3Q13509 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TUBB3Q13509 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TUBB3Q13509 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TUBB3Q13509 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TUBB3Q13509 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TUBB3Q13509 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TUBB3Q13509 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TUBB3Q13509 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TUBB3Q13509 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TUBB3Q13509 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TUBB3Q13509 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TUBB3Q13509 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TUBB3Q13509 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TUBB3Q13509 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TUBB3Q13509 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TUBB3Q13509 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TUBB3Q13509 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TUBB3Q13509 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TUBB3Q13509 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TUBB3Q13509 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TUBB3Q13509 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TUBB3Q13509 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TUBB3Q13509 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TUBB3Q13509 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TUBB3Q13509 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TUBB3Q13509 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TUBB3Q13509 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TUBB3Q13509 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TUBB3Q13509 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TUBB3Q13509 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TUBB3Q13509 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TUBB3Q13509 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TUBB3Q13509 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TUBB3Q13509 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TUBB3Q13509 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
TUBB3Q13509 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TUBB3Q13509 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TUBB3Q13509 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBB3Q13509 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBB3Q13509 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBB3Q13509 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBB3Q13509 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBB3Q13509 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBB3Q13509 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBB3Q13509 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBB3Q13509 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBB3Q13509 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBB3Q13509 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBB3Q13509 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBB3Q13509 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBB3Q13509 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBB3Q13509 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBB3Q13509 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBB3Q13509 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
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TUBB3Q13509 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBB3Q13509 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBB3Q13509 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBB3Q13509 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBB3Q13509 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBB3Q13509 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBB3Q13509 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBB3Q13509 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBB3Q13509 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBB3Q13509 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBB3Q13509 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBB3Q13509 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBB3Q13509 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBB3Q13509 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBB3Q13509 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBB3Q13509 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBB3Q13509 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBB3Q13509 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBB3Q13509 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBB3Q13509 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBB3Q13509 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBB3Q13509 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBB3Q13509 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBB3Q13509 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBB3Q13509 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBB3Q13509 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBB3Q13509 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBB3Q13509 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBB3Q13509 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBB3Q13509 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBB3Q13509 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBB3Q13509 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBB3Q13509 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBB3Q13509 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBB3Q13509 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
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