Protein–RNA interactions for Protein: Q13309

SKP2, S-phase kinase-associated protein 2, humanhuman

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Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP2Q13309 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SKP2Q13309 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SKP2Q13309 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SKP2Q13309 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SKP2Q13309 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SKP2Q13309 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SKP2Q13309 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SKP2Q13309 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SKP2Q13309 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SKP2Q13309 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SKP2Q13309 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SKP2Q13309 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SKP2Q13309 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SKP2Q13309 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SKP2Q13309 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SKP2Q13309 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SKP2Q13309 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SKP2Q13309 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SKP2Q13309 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SKP2Q13309 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SKP2Q13309 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SKP2Q13309 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SKP2Q13309 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SKP2Q13309 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SKP2Q13309 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SKP2Q13309 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
SKP2Q13309 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
SKP2Q13309 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
SKP2Q13309 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SKP2Q13309 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SKP2Q13309 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SKP2Q13309 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SKP2Q13309 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SKP2Q13309 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SKP2Q13309 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SKP2Q13309 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SKP2Q13309 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SKP2Q13309 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SKP2Q13309 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SKP2Q13309 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
SKP2Q13309 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
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SKP2Q13309 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
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SKP2Q13309 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SKP2Q13309 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
SKP2Q13309 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
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SKP2Q13309 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC14.11□□□□□ -0.15
SKP2Q13309 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
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SKP2Q13309 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
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SKP2Q13309 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SKP2Q13309 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC14.1□□□□□ -0.15
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SKP2Q13309 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SKP2Q13309 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SKP2Q13309 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SKP2Q13309 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SKP2Q13309 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
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SKP2Q13309 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
SKP2Q13309 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
SKP2Q13309 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SKP2Q13309 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SKP2Q13309 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SKP2Q13309 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SKP2Q13309 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SKP2Q13309 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SKP2Q13309 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SKP2Q13309 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SKP2Q13309 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SKP2Q13309 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SKP2Q13309 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SKP2Q13309 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
SKP2Q13309 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
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