Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
IFT88Q13099 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
IFT88Q13099 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
IFT88Q13099 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
IFT88Q13099 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
IFT88Q13099 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
IFT88Q13099 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
IFT88Q13099 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
IFT88Q13099 TRPV4-202ENST00000418703 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
IFT88Q13099 PHYHIP-202ENST00000454243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
IFT88Q13099 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
IFT88Q13099 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
IFT88Q13099 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
IFT88Q13099 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
IFT88Q13099 RNF183-206ENST00000478815 2312 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
IFT88Q13099 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
IFT88Q13099 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
IFT88Q13099 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
IFT88Q13099 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
IFT88Q13099 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
IFT88Q13099 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
IFT88Q13099 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
IFT88Q13099 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
IFT88Q13099 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
IFT88Q13099 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
IFT88Q13099 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
IFT88Q13099 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
IFT88Q13099 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
IFT88Q13099 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
IFT88Q13099 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IFT88Q13099 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IFT88Q13099 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
IFT88Q13099 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IFT88Q13099 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IFT88Q13099 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
IFT88Q13099 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
IFT88Q13099 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IFT88Q13099 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IFT88Q13099 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IFT88Q13099 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
IFT88Q13099 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IFT88Q13099 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IFT88Q13099 ZBTB20-215ENST00000481632 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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IFT88Q13099 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IFT88Q13099 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IFT88Q13099 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IFT88Q13099 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
IFT88Q13099 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IFT88Q13099 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IFT88Q13099 AC016876.1-201ENST00000415124 352 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
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IFT88Q13099 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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IFT88Q13099 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
IFT88Q13099 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
IFT88Q13099 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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IFT88Q13099 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
IFT88Q13099 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
IFT88Q13099 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IFT88Q13099 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IFT88Q13099 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IFT88Q13099 ADAMTS7P1-201ENST00000613213 4793 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
IFT88Q13099 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IFT88Q13099 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IFT88Q13099 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
IFT88Q13099 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IFT88Q13099 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
IFT88Q13099 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
IFT88Q13099 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
IFT88Q13099 PTPA-205ENST00000357197 2653 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
IFT88Q13099 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
IFT88Q13099 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
IFT88Q13099 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
IFT88Q13099 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
IFT88Q13099 ZNF718-202ENST00000609714 2772 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
IFT88Q13099 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
IFT88Q13099 TAOK2-204ENST00000543033 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
IFT88Q13099 STK32B-201ENST00000282908 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
IFT88Q13099 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
IFT88Q13099 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
IFT88Q13099 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
IFT88Q13099 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
IFT88Q13099 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
IFT88Q13099 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
IFT88Q13099 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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