Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PTPN13Q12923 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PTPN13Q12923 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PTPN13Q12923 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PTPN13Q12923 CSF2RA-219ENST00000501036 1622 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PTPN13Q12923 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
PTPN13Q12923 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PTPN13Q12923 NUDT2-201ENST00000346365 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PTPN13Q12923 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PTPN13Q12923 NUDT2-202ENST00000379155 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PTPN13Q12923 ATP5J-202ENST00000400087 826 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PTPN13Q12923 LINC01388-201ENST00000416242 416 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PTPN13Q12923 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PTPN13Q12923 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PTPN13Q12923 AC004837.1-201ENST00000446267 564 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
PTPN13Q12923 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PTPN13Q12923 AC108724.1-201ENST00000481669 352 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
PTPN13Q12923 AC023906.1-201ENST00000486386 453 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
PTPN13Q12923 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PTPN13Q12923 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
PTPN13Q12923 NUDT2-204ENST00000618590 825 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PTPN13Q12923 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PTPN13Q12923 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PTPN13Q12923 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PTPN13Q12923 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PTPN13Q12923 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PTPN13Q12923 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PTPN13Q12923 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PTPN13Q12923 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PTPN13Q12923 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PTPN13Q12923 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PTPN13Q12923 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PTPN13Q12923 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PTPN13Q12923 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PTPN13Q12923 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PTPN13Q12923 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PTPN13Q12923 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PTPN13Q12923 ZNF226-201ENST00000300823 817 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PTPN13Q12923 LCE3B-201ENST00000335633 288 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
PTPN13Q12923 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PTPN13Q12923 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
PTPN13Q12923 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PTPN13Q12923 CTHRC1-202ENST00000415886 571 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
PTPN13Q12923 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
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PTPN13Q12923 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
PTPN13Q12923 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
PTPN13Q12923 LINC02176-201ENST00000569104 598 ntTSL 4 BASIC13.22□□□□□ -0.29
PTPN13Q12923 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
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PTPN13Q12923 DNAJC10-211ENST00000640034 888 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
PTPN13Q12923 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
PTPN13Q12923 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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PTPN13Q12923 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PTPN13Q12923 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PTPN13Q12923 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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PTPN13Q12923 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
PTPN13Q12923 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PTPN13Q12923 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
PTPN13Q12923 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
PTPN13Q12923 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PTPN13Q12923 ATF4-203ENST00000404241 1910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PTPN13Q12923 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PTPN13Q12923 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PTPN13Q12923 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PTPN13Q12923 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PTPN13Q12923 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PTPN13Q12923 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PTPN13Q12923 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PTPN13Q12923 AC097381.2-201ENST00000510640 859 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PTPN13Q12923 AC108471.2-201ENST00000533736 1061 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PTPN13Q12923 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
PTPN13Q12923 RBFOX3-206ENST00000582043 1143 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PTPN13Q12923 RN7SL470P-201ENST00000583069 259 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
PTPN13Q12923 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PTPN13Q12923 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PTPN13Q12923 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PTPN13Q12923 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PTPN13Q12923 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PTPN13Q12923 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PTPN13Q12923 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PTPN13Q12923 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
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