Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

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Length 3,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BPTFQ12830 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
BPTFQ12830 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BPTFQ12830 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
BPTFQ12830 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BPTFQ12830 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BPTFQ12830 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BPTFQ12830 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BPTFQ12830 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BPTFQ12830 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
BPTFQ12830 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BPTFQ12830 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
BPTFQ12830 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
BPTFQ12830 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
BPTFQ12830 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BPTFQ12830 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
BPTFQ12830 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
BPTFQ12830 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BPTFQ12830 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BPTFQ12830 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
BPTFQ12830 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
BPTFQ12830 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BPTFQ12830 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
BPTFQ12830 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BPTFQ12830 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BPTFQ12830 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BPTFQ12830 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BPTFQ12830 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BPTFQ12830 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
BPTFQ12830 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
BPTFQ12830 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
BPTFQ12830 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
BPTFQ12830 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
BPTFQ12830 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
BPTFQ12830 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
BPTFQ12830 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
BPTFQ12830 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
BPTFQ12830 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BPTFQ12830 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
BPTFQ12830 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
BPTFQ12830 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BPTFQ12830 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BPTFQ12830 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BPTFQ12830 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
BPTFQ12830 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
BPTFQ12830 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
BPTFQ12830 HILPDA-202ENST00000435296 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
BPTFQ12830 AC253536.4-201ENST00000440539 267 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
BPTFQ12830 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
BPTFQ12830 AC020763.1-201ENST00000567186 551 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
BPTFQ12830 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
BPTFQ12830 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
BPTFQ12830 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BPTFQ12830 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BPTFQ12830 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
BPTFQ12830 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BPTFQ12830 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
BPTFQ12830 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
BPTFQ12830 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
BPTFQ12830 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
BPTFQ12830 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BPTFQ12830 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
BPTFQ12830 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BPTFQ12830 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BPTFQ12830 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BPTFQ12830 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
BPTFQ12830 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
BPTFQ12830 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
BPTFQ12830 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BPTFQ12830 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BPTFQ12830 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
BPTFQ12830 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BPTFQ12830 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BPTFQ12830 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
BPTFQ12830 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
BPTFQ12830 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
BPTFQ12830 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
BPTFQ12830 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
BPTFQ12830 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
BPTFQ12830 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BPTFQ12830 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
BPTFQ12830 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BPTFQ12830 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
BPTFQ12830 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BPTFQ12830 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
BPTFQ12830 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
BPTFQ12830 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
BPTFQ12830 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
BPTFQ12830 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
BPTFQ12830 RPS2P36-201ENST00000456516 831 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
BPTFQ12830 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
BPTFQ12830 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
BPTFQ12830 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
BPTFQ12830 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
BPTFQ12830 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
BPTFQ12830 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
BPTFQ12830 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
BPTFQ12830 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BPTFQ12830 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BPTFQ12830 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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