Protein–RNA interactions for Protein: Q07864

POLE, DNA polymerase epsilon catalytic subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 2,286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLEQ07864 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
POLEQ07864 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
POLEQ07864 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
POLEQ07864 AC090386.1-202ENST00000586610 469 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
POLEQ07864 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC13.71□□□□□ -0.21
POLEQ07864 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
POLEQ07864 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
POLEQ07864 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
POLEQ07864 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
POLEQ07864 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
POLEQ07864 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
POLEQ07864 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
POLEQ07864 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
POLEQ07864 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
POLEQ07864 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
POLEQ07864 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
POLEQ07864 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
POLEQ07864 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
POLEQ07864 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
POLEQ07864 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
POLEQ07864 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
POLEQ07864 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
POLEQ07864 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
POLEQ07864 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
POLEQ07864 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
POLEQ07864 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
POLEQ07864 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
POLEQ07864 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
POLEQ07864 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
POLEQ07864 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
POLEQ07864 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
POLEQ07864 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
POLEQ07864 KAZN-204ENST00000400797 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
POLEQ07864 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
POLEQ07864 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
POLEQ07864 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
POLEQ07864 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
POLEQ07864 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
POLEQ07864 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
POLEQ07864 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
POLEQ07864 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
POLEQ07864 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
POLEQ07864 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
POLEQ07864 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
POLEQ07864 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
POLEQ07864 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
POLEQ07864 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
POLEQ07864 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
POLEQ07864 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
POLEQ07864 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
POLEQ07864 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
POLEQ07864 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
POLEQ07864 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
POLEQ07864 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
POLEQ07864 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
POLEQ07864 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
POLEQ07864 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
POLEQ07864 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
POLEQ07864 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
POLEQ07864 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
POLEQ07864 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
POLEQ07864 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
POLEQ07864 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
POLEQ07864 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
POLEQ07864 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
POLEQ07864 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
POLEQ07864 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
POLEQ07864 ARL16-201ENST00000397498 1227 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
POLEQ07864 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
POLEQ07864 AC083949.1-201ENST00000422013 657 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
POLEQ07864 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
POLEQ07864 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
POLEQ07864 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
POLEQ07864 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
POLEQ07864 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC13.7□□□□□ -0.22
POLEQ07864 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
POLEQ07864 ARL16-214ENST00000621051 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
POLEQ07864 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
POLEQ07864 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
POLEQ07864 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
POLEQ07864 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
POLEQ07864 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
POLEQ07864 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
POLEQ07864 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
POLEQ07864 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
POLEQ07864 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
POLEQ07864 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
POLEQ07864 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
POLEQ07864 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
POLEQ07864 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
POLEQ07864 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
POLEQ07864 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
POLEQ07864 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
POLEQ07864 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
POLEQ07864 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
POLEQ07864 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
POLEQ07864 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
POLEQ07864 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
POLEQ07864 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
POLEQ07864 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms