Protein–RNA interactions for Protein: Q06710

PAX8, Paired box protein Pax-8, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX8Q06710 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PAX8Q06710 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PAX8Q06710 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
PAX8Q06710 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PAX8Q06710 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
PAX8Q06710 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PAX8Q06710 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PAX8Q06710 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PAX8Q06710 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
PAX8Q06710 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
PAX8Q06710 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
PAX8Q06710 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PAX8Q06710 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PAX8Q06710 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PAX8Q06710 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
PAX8Q06710 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PAX8Q06710 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
PAX8Q06710 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
PAX8Q06710 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PAX8Q06710 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
PAX8Q06710 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PAX8Q06710 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
PAX8Q06710 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PAX8Q06710 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
PAX8Q06710 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
PAX8Q06710 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
PAX8Q06710 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
PAX8Q06710 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
PAX8Q06710 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
PAX8Q06710 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
PAX8Q06710 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
PAX8Q06710 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
PAX8Q06710 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
PAX8Q06710 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC12.68□□□□□ -0.38
PAX8Q06710 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PAX8Q06710 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
PAX8Q06710 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
PAX8Q06710 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
PAX8Q06710 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PAX8Q06710 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
PAX8Q06710 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PAX8Q06710 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
PAX8Q06710 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PAX8Q06710 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PAX8Q06710 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
PAX8Q06710 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PAX8Q06710 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
PAX8Q06710 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PAX8Q06710 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
PAX8Q06710 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PAX8Q06710 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
PAX8Q06710 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
PAX8Q06710 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PAX8Q06710 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PAX8Q06710 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PAX8Q06710 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PAX8Q06710 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PAX8Q06710 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PAX8Q06710 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PAX8Q06710 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
PAX8Q06710 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PAX8Q06710 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PAX8Q06710 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PAX8Q06710 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PAX8Q06710 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
PAX8Q06710 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
PAX8Q06710 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PAX8Q06710 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PAX8Q06710 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PAX8Q06710 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
PAX8Q06710 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PAX8Q06710 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PAX8Q06710 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
PAX8Q06710 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
PAX8Q06710 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
PAX8Q06710 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
PAX8Q06710 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PAX8Q06710 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
PAX8Q06710 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PAX8Q06710 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PAX8Q06710 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PAX8Q06710 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
PAX8Q06710 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
PAX8Q06710 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
PAX8Q06710 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
PAX8Q06710 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PAX8Q06710 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
PAX8Q06710 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
PAX8Q06710 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PAX8Q06710 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
PAX8Q06710 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
PAX8Q06710 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC12.67□□□□□ -0.38
PAX8Q06710 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
PAX8Q06710 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
PAX8Q06710 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
PAX8Q06710 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
PAX8Q06710 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PAX8Q06710 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PAX8Q06710 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PAX8Q06710 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.6 ms