Protein–RNA interactions for Protein: Q05D60

DEUP1, Deuterosome assembly protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEUP1Q05D60 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DEUP1Q05D60 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DEUP1Q05D60 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DEUP1Q05D60 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
DEUP1Q05D60 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
DEUP1Q05D60 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
DEUP1Q05D60 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DEUP1Q05D60 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DEUP1Q05D60 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
DEUP1Q05D60 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DEUP1Q05D60 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DEUP1Q05D60 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DEUP1Q05D60 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
DEUP1Q05D60 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
DEUP1Q05D60 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DEUP1Q05D60 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DEUP1Q05D60 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
DEUP1Q05D60 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
DEUP1Q05D60 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
DEUP1Q05D60 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
DEUP1Q05D60 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
DEUP1Q05D60 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
DEUP1Q05D60 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DEUP1Q05D60 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
DEUP1Q05D60 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DEUP1Q05D60 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
DEUP1Q05D60 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
DEUP1Q05D60 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
DEUP1Q05D60 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DEUP1Q05D60 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
DEUP1Q05D60 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
DEUP1Q05D60 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DEUP1Q05D60 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DEUP1Q05D60 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DEUP1Q05D60 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DEUP1Q05D60 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
DEUP1Q05D60 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
DEUP1Q05D60 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
DEUP1Q05D60 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
DEUP1Q05D60 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
DEUP1Q05D60 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DEUP1Q05D60 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
DEUP1Q05D60 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DEUP1Q05D60 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
DEUP1Q05D60 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DEUP1Q05D60 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
DEUP1Q05D60 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
DEUP1Q05D60 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DEUP1Q05D60 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DEUP1Q05D60 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DEUP1Q05D60 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DEUP1Q05D60 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
DEUP1Q05D60 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
DEUP1Q05D60 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
DEUP1Q05D60 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
DEUP1Q05D60 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DEUP1Q05D60 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
DEUP1Q05D60 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DEUP1Q05D60 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DEUP1Q05D60 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DEUP1Q05D60 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
DEUP1Q05D60 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DEUP1Q05D60 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
DEUP1Q05D60 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DEUP1Q05D60 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
DEUP1Q05D60 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DEUP1Q05D60 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DEUP1Q05D60 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DEUP1Q05D60 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DEUP1Q05D60 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
DEUP1Q05D60 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
DEUP1Q05D60 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
DEUP1Q05D60 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
DEUP1Q05D60 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
DEUP1Q05D60 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
DEUP1Q05D60 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
DEUP1Q05D60 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
DEUP1Q05D60 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
DEUP1Q05D60 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
DEUP1Q05D60 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DEUP1Q05D60 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DEUP1Q05D60 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
DEUP1Q05D60 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
DEUP1Q05D60 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
DEUP1Q05D60 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.19
DEUP1Q05D60 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
DEUP1Q05D60 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
DEUP1Q05D60 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
DEUP1Q05D60 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
DEUP1Q05D60 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
DEUP1Q05D60 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
DEUP1Q05D60 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
DEUP1Q05D60 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DEUP1Q05D60 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DEUP1Q05D60 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DEUP1Q05D60 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DEUP1Q05D60 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DEUP1Q05D60 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DEUP1Q05D60 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DEUP1Q05D60 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 376 ms