Protein–RNA interactions for Protein: Q02577

NHLH2, Helix-loop-helix protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLH2Q02577 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
NHLH2Q02577 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
NHLH2Q02577 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
NHLH2Q02577 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
NHLH2Q02577 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
NHLH2Q02577 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
NHLH2Q02577 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC12.64□□□□□ -0.39
NHLH2Q02577 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
NHLH2Q02577 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
NHLH2Q02577 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
NHLH2Q02577 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
NHLH2Q02577 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
NHLH2Q02577 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
NHLH2Q02577 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
NHLH2Q02577 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
NHLH2Q02577 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
NHLH2Q02577 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
NHLH2Q02577 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
NHLH2Q02577 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
NHLH2Q02577 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
NHLH2Q02577 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
NHLH2Q02577 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC12.64□□□□□ -0.39
NHLH2Q02577 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
NHLH2Q02577 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
NHLH2Q02577 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
NHLH2Q02577 FAM219A-203ENST00000379080 3591 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
NHLH2Q02577 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
NHLH2Q02577 EHMT2-201ENST00000375528 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
NHLH2Q02577 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
NHLH2Q02577 ITGB4-203ENST00000450894 5645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
NHLH2Q02577 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
NHLH2Q02577 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
NHLH2Q02577 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
NHLH2Q02577 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
NHLH2Q02577 PLXNB3-209ENST00000538966 6377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
NHLH2Q02577 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
NHLH2Q02577 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
NHLH2Q02577 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
NHLH2Q02577 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
NHLH2Q02577 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
NHLH2Q02577 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
NHLH2Q02577 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
NHLH2Q02577 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
NHLH2Q02577 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
NHLH2Q02577 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
NHLH2Q02577 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
NHLH2Q02577 ZBTB47-201ENST00000232974 3781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
NHLH2Q02577 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
NHLH2Q02577 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
NHLH2Q02577 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
NHLH2Q02577 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
NHLH2Q02577 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
NHLH2Q02577 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
NHLH2Q02577 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
NHLH2Q02577 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
NHLH2Q02577 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
NHLH2Q02577 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
NHLH2Q02577 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
NHLH2Q02577 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
NHLH2Q02577 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
NHLH2Q02577 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
NHLH2Q02577 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
NHLH2Q02577 RTF1-201ENST00000389629 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
NHLH2Q02577 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
NHLH2Q02577 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
NHLH2Q02577 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
NHLH2Q02577 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
NHLH2Q02577 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
NHLH2Q02577 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
NHLH2Q02577 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
NHLH2Q02577 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
NHLH2Q02577 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
NHLH2Q02577 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
NHLH2Q02577 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
NHLH2Q02577 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
NHLH2Q02577 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
NHLH2Q02577 ABLIM2-213ENST00000514025 2974 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
NHLH2Q02577 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
NHLH2Q02577 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
NHLH2Q02577 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
NHLH2Q02577 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
NHLH2Q02577 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
NHLH2Q02577 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
NHLH2Q02577 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
NHLH2Q02577 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
NHLH2Q02577 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
NHLH2Q02577 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
NHLH2Q02577 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
NHLH2Q02577 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
NHLH2Q02577 ATP2B3-201ENST00000263519 6420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
NHLH2Q02577 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
NHLH2Q02577 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
NHLH2Q02577 VPS26B-201ENST00000281187 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
NHLH2Q02577 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
NHLH2Q02577 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
NHLH2Q02577 GALNT3-201ENST00000392701 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
NHLH2Q02577 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
NHLH2Q02577 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
NHLH2Q02577 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
NHLH2Q02577 ARPC4-TTLL3-201ENST00000397256 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms