Protein–RNA interactions for Protein: Q01850

CDR2, Cerebellar degeneration-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDR2Q01850 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDR2Q01850 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDR2Q01850 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDR2Q01850 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDR2Q01850 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDR2Q01850 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDR2Q01850 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDR2Q01850 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDR2Q01850 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDR2Q01850 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDR2Q01850 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDR2Q01850 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDR2Q01850 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDR2Q01850 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDR2Q01850 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDR2Q01850 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDR2Q01850 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDR2Q01850 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDR2Q01850 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDR2Q01850 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDR2Q01850 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDR2Q01850 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDR2Q01850 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDR2Q01850 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDR2Q01850 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDR2Q01850 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDR2Q01850 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDR2Q01850 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDR2Q01850 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CDR2Q01850 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CDR2Q01850 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDR2Q01850 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDR2Q01850 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDR2Q01850 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDR2Q01850 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDR2Q01850 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDR2Q01850 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CDR2Q01850 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDR2Q01850 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDR2Q01850 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDR2Q01850 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDR2Q01850 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDR2Q01850 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDR2Q01850 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CDR2Q01850 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDR2Q01850 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDR2Q01850 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDR2Q01850 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDR2Q01850 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDR2Q01850 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDR2Q01850 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDR2Q01850 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDR2Q01850 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDR2Q01850 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDR2Q01850 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDR2Q01850 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDR2Q01850 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDR2Q01850 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDR2Q01850 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDR2Q01850 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDR2Q01850 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDR2Q01850 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CDR2Q01850 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDR2Q01850 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDR2Q01850 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDR2Q01850 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDR2Q01850 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDR2Q01850 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDR2Q01850 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDR2Q01850 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDR2Q01850 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDR2Q01850 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDR2Q01850 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDR2Q01850 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDR2Q01850 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDR2Q01850 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDR2Q01850 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDR2Q01850 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDR2Q01850 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CDR2Q01850 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDR2Q01850 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDR2Q01850 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDR2Q01850 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDR2Q01850 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDR2Q01850 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDR2Q01850 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDR2Q01850 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDR2Q01850 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CDR2Q01850 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CDR2Q01850 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CDR2Q01850 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDR2Q01850 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CDR2Q01850 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDR2Q01850 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CDR2Q01850 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CDR2Q01850 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CDR2Q01850 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CDR2Q01850 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CDR2Q01850 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CDR2Q01850 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms