Protein–RNA interactions for Protein: Q00536

CDK16, Cyclin-dependent kinase 16, humanhuman

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK16Q00536 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDK16Q00536 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDK16Q00536 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDK16Q00536 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDK16Q00536 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDK16Q00536 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDK16Q00536 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDK16Q00536 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDK16Q00536 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CDK16Q00536 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDK16Q00536 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDK16Q00536 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDK16Q00536 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDK16Q00536 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDK16Q00536 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDK16Q00536 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDK16Q00536 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDK16Q00536 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDK16Q00536 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDK16Q00536 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDK16Q00536 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDK16Q00536 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDK16Q00536 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDK16Q00536 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDK16Q00536 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDK16Q00536 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDK16Q00536 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDK16Q00536 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDK16Q00536 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CDK16Q00536 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDK16Q00536 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDK16Q00536 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDK16Q00536 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDK16Q00536 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDK16Q00536 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDK16Q00536 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDK16Q00536 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDK16Q00536 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDK16Q00536 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CDK16Q00536 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDK16Q00536 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDK16Q00536 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDK16Q00536 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDK16Q00536 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDK16Q00536 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDK16Q00536 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDK16Q00536 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDK16Q00536 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDK16Q00536 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDK16Q00536 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDK16Q00536 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDK16Q00536 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDK16Q00536 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDK16Q00536 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDK16Q00536 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK16Q00536 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK16Q00536 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK16Q00536 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK16Q00536 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK16Q00536 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK16Q00536 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK16Q00536 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK16Q00536 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK16Q00536 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK16Q00536 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK16Q00536 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK16Q00536 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK16Q00536 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK16Q00536 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK16Q00536 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK16Q00536 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK16Q00536 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK16Q00536 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK16Q00536 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK16Q00536 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK16Q00536 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK16Q00536 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK16Q00536 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK16Q00536 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK16Q00536 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK16Q00536 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK16Q00536 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK16Q00536 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK16Q00536 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK16Q00536 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK16Q00536 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK16Q00536 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK16Q00536 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK16Q00536 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK16Q00536 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK16Q00536 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK16Q00536 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK16Q00536 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK16Q00536 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK16Q00536 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK16Q00536 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK16Q00536 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK16Q00536 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK16Q00536 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK16Q00536 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms