Protein–RNA interactions for Protein: P84022

SMAD3, Mothers against decapentaplegic homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD3P84022 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMAD3P84022 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMAD3P84022 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMAD3P84022 AC242376.1-201ENST00000559033 726 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SMAD3P84022 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMAD3P84022 AC141586.1-203ENST00000567242 366 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SMAD3P84022 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMAD3P84022 RNASEK-210ENST00000593646 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMAD3P84022 GMFG-209ENST00000600322 622 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMAD3P84022 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMAD3P84022 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMAD3P84022 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMAD3P84022 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SMAD3P84022 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMAD3P84022 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMAD3P84022 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMAD3P84022 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMAD3P84022 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMAD3P84022 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMAD3P84022 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMAD3P84022 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SMAD3P84022 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMAD3P84022 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMAD3P84022 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMAD3P84022 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMAD3P84022 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMAD3P84022 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMAD3P84022 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMAD3P84022 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMAD3P84022 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMAD3P84022 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMAD3P84022 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMAD3P84022 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SMAD3P84022 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMAD3P84022 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMAD3P84022 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMAD3P84022 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMAD3P84022 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SMAD3P84022 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMAD3P84022 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMAD3P84022 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMAD3P84022 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMAD3P84022 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMAD3P84022 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMAD3P84022 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMAD3P84022 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMAD3P84022 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMAD3P84022 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMAD3P84022 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMAD3P84022 TPM1-202ENST00000288398 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMAD3P84022 SYCN-201ENST00000318438 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMAD3P84022 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMAD3P84022 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMAD3P84022 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMAD3P84022 RPL7P35-201ENST00000446943 740 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SMAD3P84022 FBXO24-204ENST00000465843 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMAD3P84022 TVP23C-205ENST00000518321 1080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMAD3P84022 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMAD3P84022 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMAD3P84022 AL845331.2-201ENST00000561882 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMAD3P84022 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMAD3P84022 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMAD3P84022 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMAD3P84022 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMAD3P84022 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMAD3P84022 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SMAD3P84022 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SMAD3P84022 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMAD3P84022 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMAD3P84022 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMAD3P84022 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMAD3P84022 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMAD3P84022 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMAD3P84022 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMAD3P84022 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMAD3P84022 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMAD3P84022 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMAD3P84022 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMAD3P84022 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMAD3P84022 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMAD3P84022 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMAD3P84022 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMAD3P84022 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMAD3P84022 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMAD3P84022 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMAD3P84022 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SMAD3P84022 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMAD3P84022 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMAD3P84022 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMAD3P84022 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMAD3P84022 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMAD3P84022 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMAD3P84022 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMAD3P84022 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMAD3P84022 CHCHD2-201ENST00000395422 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMAD3P84022 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMAD3P84022 VEGFB-202ENST00000426086 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMAD3P84022 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SMAD3P84022 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMAD3P84022 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.3 ms