Protein–RNA interactions for Protein: P62873

GNB1, Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(T) subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNB1P62873 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
GNB1P62873 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
GNB1P62873 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
GNB1P62873 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
GNB1P62873 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
GNB1P62873 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
GNB1P62873 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
GNB1P62873 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
GNB1P62873 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
GNB1P62873 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
GNB1P62873 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
GNB1P62873 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
GNB1P62873 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
GNB1P62873 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
GNB1P62873 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
GNB1P62873 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
GNB1P62873 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
GNB1P62873 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
GNB1P62873 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
GNB1P62873 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
GNB1P62873 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
GNB1P62873 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
GNB1P62873 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
GNB1P62873 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
GNB1P62873 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
GNB1P62873 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
GNB1P62873 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
GNB1P62873 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
GNB1P62873 TMEM2-202ENST00000377044 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
GNB1P62873 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
GNB1P62873 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
GNB1P62873 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
GNB1P62873 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
GNB1P62873 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
GNB1P62873 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
GNB1P62873 LINC00174-204ENST00000421767 4702 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
GNB1P62873 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
GNB1P62873 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
GNB1P62873 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
GNB1P62873 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC12.75□□□□□ -0.37
GNB1P62873 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
GNB1P62873 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
GNB1P62873 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
GNB1P62873 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
GNB1P62873 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
GNB1P62873 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
GNB1P62873 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
GNB1P62873 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
GNB1P62873 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
GNB1P62873 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
GNB1P62873 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
GNB1P62873 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
GNB1P62873 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
GNB1P62873 COL4A1-201ENST00000375820 6532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
GNB1P62873 UMODL1-206ENST00000408989 5262 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
GNB1P62873 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
GNB1P62873 NDFIP2-205ENST00000612570 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
GNB1P62873 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
GNB1P62873 SPECC1L-ADORA2A-201ENST00000358654 6204 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
GNB1P62873 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
GNB1P62873 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
GNB1P62873 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
GNB1P62873 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
GNB1P62873 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
GNB1P62873 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
GNB1P62873 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
GNB1P62873 ZC3HAV1-203ENST00000464606 4776 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
GNB1P62873 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
GNB1P62873 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
GNB1P62873 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
GNB1P62873 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
GNB1P62873 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
GNB1P62873 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
GNB1P62873 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
GNB1P62873 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
GNB1P62873 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
GNB1P62873 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
GNB1P62873 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
GNB1P62873 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
GNB1P62873 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
GNB1P62873 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
GNB1P62873 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
GNB1P62873 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
GNB1P62873 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC12.74□□□□□ -0.37
GNB1P62873 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
GNB1P62873 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
GNB1P62873 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
GNB1P62873 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
GNB1P62873 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
GNB1P62873 GOLGA2P7-207ENST00000559668 4253 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
GNB1P62873 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
GNB1P62873 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
GNB1P62873 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
GNB1P62873 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
GNB1P62873 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
GNB1P62873 PRDM10-204ENST00000423662 5998 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
GNB1P62873 CDK12-201ENST00000430627 5918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
GNB1P62873 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
GNB1P62873 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
GNB1P62873 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms