Protein–RNA interactions for Protein: P61247

RPS3A, 40S ribosomal protein S3a, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3AP61247 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RPS3AP61247 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
RPS3AP61247 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RPS3AP61247 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RPS3AP61247 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RPS3AP61247 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RPS3AP61247 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RPS3AP61247 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RPS3AP61247 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RPS3AP61247 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RPS3AP61247 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
RPS3AP61247 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RPS3AP61247 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RPS3AP61247 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RPS3AP61247 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RPS3AP61247 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RPS3AP61247 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RPS3AP61247 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RPS3AP61247 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RPS3AP61247 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RPS3AP61247 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RPS3AP61247 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RPS3AP61247 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RPS3AP61247 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RPS3AP61247 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RPS3AP61247 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
RPS3AP61247 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RPS3AP61247 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
RPS3AP61247 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
RPS3AP61247 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RPS3AP61247 TMPRSS6-201ENST00000346753 3197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RPS3AP61247 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RPS3AP61247 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RPS3AP61247 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RPS3AP61247 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RPS3AP61247 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RPS3AP61247 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RPS3AP61247 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RPS3AP61247 DMTN-214ENST00000519907 2658 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RPS3AP61247 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RPS3AP61247 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RPS3AP61247 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RPS3AP61247 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RPS3AP61247 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RPS3AP61247 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RPS3AP61247 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RPS3AP61247 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RPS3AP61247 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RPS3AP61247 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RPS3AP61247 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RPS3AP61247 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RPS3AP61247 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RPS3AP61247 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RPS3AP61247 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RPS3AP61247 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
RPS3AP61247 DEPTOR-201ENST00000286234 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RPS3AP61247 RLIM-202ENST00000349225 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RPS3AP61247 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RPS3AP61247 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RPS3AP61247 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RPS3AP61247 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RPS3AP61247 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RPS3AP61247 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RPS3AP61247 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RPS3AP61247 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RPS3AP61247 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RPS3AP61247 TCAF2-202ENST00000411935 2906 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RPS3AP61247 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RPS3AP61247 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RPS3AP61247 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RPS3AP61247 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RPS3AP61247 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RPS3AP61247 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RPS3AP61247 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RPS3AP61247 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
RPS3AP61247 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RPS3AP61247 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RPS3AP61247 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RPS3AP61247 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
RPS3AP61247 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RPS3AP61247 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RPS3AP61247 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
RPS3AP61247 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RPS3AP61247 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RPS3AP61247 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RPS3AP61247 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RPS3AP61247 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RPS3AP61247 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
RPS3AP61247 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RPS3AP61247 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RPS3AP61247 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RPS3AP61247 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RPS3AP61247 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RPS3AP61247 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RPS3AP61247 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RPS3AP61247 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RPS3AP61247 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RPS3AP61247 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RPS3AP61247 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RPS3AP61247 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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