Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PGGT1BP53609 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PGGT1BP53609 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PGGT1BP53609 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PGGT1BP53609 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PGGT1BP53609 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
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PGGT1BP53609 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PGGT1BP53609 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PGGT1BP53609 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PGGT1BP53609 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PGGT1BP53609 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PGGT1BP53609 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
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PGGT1BP53609 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
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PGGT1BP53609 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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PGGT1BP53609 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PGGT1BP53609 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
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PGGT1BP53609 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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PGGT1BP53609 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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PGGT1BP53609 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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PGGT1BP53609 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PGGT1BP53609 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PGGT1BP53609 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
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