Protein–RNA interactions for Protein: P48730

CSNK1D, Casein kinase I isoform delta, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK1DP48730 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSNK1DP48730 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSNK1DP48730 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSNK1DP48730 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSNK1DP48730 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSNK1DP48730 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSNK1DP48730 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CSNK1DP48730 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSNK1DP48730 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSNK1DP48730 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CSNK1DP48730 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSNK1DP48730 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSNK1DP48730 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSNK1DP48730 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CSNK1DP48730 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSNK1DP48730 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSNK1DP48730 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CSNK1DP48730 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSNK1DP48730 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSNK1DP48730 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSNK1DP48730 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSNK1DP48730 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSNK1DP48730 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSNK1DP48730 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSNK1DP48730 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSNK1DP48730 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CSNK1DP48730 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSNK1DP48730 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSNK1DP48730 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSNK1DP48730 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSNK1DP48730 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSNK1DP48730 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSNK1DP48730 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSNK1DP48730 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSNK1DP48730 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSNK1DP48730 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSNK1DP48730 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSNK1DP48730 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSNK1DP48730 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSNK1DP48730 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSNK1DP48730 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSNK1DP48730 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSNK1DP48730 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSNK1DP48730 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSNK1DP48730 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSNK1DP48730 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSNK1DP48730 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSNK1DP48730 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSNK1DP48730 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSNK1DP48730 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSNK1DP48730 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSNK1DP48730 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSNK1DP48730 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSNK1DP48730 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSNK1DP48730 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSNK1DP48730 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSNK1DP48730 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSNK1DP48730 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSNK1DP48730 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSNK1DP48730 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSNK1DP48730 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSNK1DP48730 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSNK1DP48730 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSNK1DP48730 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSNK1DP48730 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSNK1DP48730 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSNK1DP48730 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CSNK1DP48730 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSNK1DP48730 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSNK1DP48730 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSNK1DP48730 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSNK1DP48730 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSNK1DP48730 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSNK1DP48730 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSNK1DP48730 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSNK1DP48730 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSNK1DP48730 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSNK1DP48730 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSNK1DP48730 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSNK1DP48730 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSNK1DP48730 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSNK1DP48730 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSNK1DP48730 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSNK1DP48730 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSNK1DP48730 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSNK1DP48730 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSNK1DP48730 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSNK1DP48730 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSNK1DP48730 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSNK1DP48730 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSNK1DP48730 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSNK1DP48730 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSNK1DP48730 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSNK1DP48730 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CSNK1DP48730 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSNK1DP48730 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSNK1DP48730 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSNK1DP48730 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSNK1DP48730 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSNK1DP48730 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms