Protein–RNA interactions for Protein: P48047

ATP5O, ATP synthase subunit O, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5OP48047 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP5OP48047 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP5OP48047 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP5OP48047 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP5OP48047 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP5OP48047 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP5OP48047 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP5OP48047 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP5OP48047 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP5OP48047 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP5OP48047 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP5OP48047 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP5OP48047 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP5OP48047 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP5OP48047 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP5OP48047 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP5OP48047 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP5OP48047 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP5OP48047 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP5OP48047 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP5OP48047 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP5OP48047 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP5OP48047 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP5OP48047 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP5OP48047 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP5OP48047 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP5OP48047 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP5OP48047 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP5OP48047 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP5OP48047 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP5OP48047 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP5OP48047 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP5OP48047 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP5OP48047 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP5OP48047 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP5OP48047 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP5OP48047 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP5OP48047 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP5OP48047 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP5OP48047 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP5OP48047 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP5OP48047 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP5OP48047 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP5OP48047 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP5OP48047 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP5OP48047 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP5OP48047 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP5OP48047 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP5OP48047 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP5OP48047 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP5OP48047 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP5OP48047 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP5OP48047 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP5OP48047 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP5OP48047 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP5OP48047 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP5OP48047 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP5OP48047 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP5OP48047 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP5OP48047 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP5OP48047 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP5OP48047 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP5OP48047 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP5OP48047 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP5OP48047 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP5OP48047 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP5OP48047 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP5OP48047 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP5OP48047 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP5OP48047 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP5OP48047 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP5OP48047 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP5OP48047 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP5OP48047 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP5OP48047 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP5OP48047 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP5OP48047 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP5OP48047 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP5OP48047 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP5OP48047 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP5OP48047 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP5OP48047 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP5OP48047 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP5OP48047 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP5OP48047 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP5OP48047 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP5OP48047 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP5OP48047 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP5OP48047 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP5OP48047 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP5OP48047 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP5OP48047 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP5OP48047 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP5OP48047 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP5OP48047 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP5OP48047 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP5OP48047 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP5OP48047 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP5OP48047 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP5OP48047 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms