Protein–RNA interactions for Protein: P47870

GABRB2, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRB2P47870 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GABRB2P47870 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GABRB2P47870 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GABRB2P47870 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GABRB2P47870 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GABRB2P47870 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GABRB2P47870 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GABRB2P47870 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GABRB2P47870 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GABRB2P47870 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GABRB2P47870 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
GABRB2P47870 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GABRB2P47870 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GABRB2P47870 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GABRB2P47870 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
GABRB2P47870 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GABRB2P47870 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GABRB2P47870 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GABRB2P47870 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GABRB2P47870 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GABRB2P47870 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GABRB2P47870 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GABRB2P47870 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GABRB2P47870 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GABRB2P47870 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GABRB2P47870 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
GABRB2P47870 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GABRB2P47870 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GABRB2P47870 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GABRB2P47870 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GABRB2P47870 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GABRB2P47870 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GABRB2P47870 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GABRB2P47870 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GABRB2P47870 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GABRB2P47870 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GABRB2P47870 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GABRB2P47870 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GABRB2P47870 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GABRB2P47870 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GABRB2P47870 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GABRB2P47870 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GABRB2P47870 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GABRB2P47870 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GABRB2P47870 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
GABRB2P47870 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GABRB2P47870 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GABRB2P47870 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GABRB2P47870 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GABRB2P47870 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GABRB2P47870 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
GABRB2P47870 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GABRB2P47870 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GABRB2P47870 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GABRB2P47870 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GABRB2P47870 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GABRB2P47870 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GABRB2P47870 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GABRB2P47870 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GABRB2P47870 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
GABRB2P47870 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GABRB2P47870 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GABRB2P47870 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GABRB2P47870 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GABRB2P47870 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GABRB2P47870 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
GABRB2P47870 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GABRB2P47870 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GABRB2P47870 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GABRB2P47870 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GABRB2P47870 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GABRB2P47870 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
GABRB2P47870 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GABRB2P47870 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GABRB2P47870 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GABRB2P47870 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GABRB2P47870 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GABRB2P47870 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GABRB2P47870 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GABRB2P47870 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GABRB2P47870 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GABRB2P47870 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABRB2P47870 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
GABRB2P47870 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABRB2P47870 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABRB2P47870 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABRB2P47870 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
GABRB2P47870 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABRB2P47870 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABRB2P47870 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABRB2P47870 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABRB2P47870 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABRB2P47870 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABRB2P47870 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABRB2P47870 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
GABRB2P47870 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABRB2P47870 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
GABRB2P47870 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
GABRB2P47870 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABRB2P47870 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56 ms