Protein–RNA interactions for Protein: P43119

PTGIR, Prostacyclin receptor, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGIRP43119 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTGIRP43119 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTGIRP43119 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTGIRP43119 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTGIRP43119 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTGIRP43119 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTGIRP43119 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTGIRP43119 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTGIRP43119 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTGIRP43119 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTGIRP43119 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTGIRP43119 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTGIRP43119 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTGIRP43119 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTGIRP43119 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTGIRP43119 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTGIRP43119 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTGIRP43119 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTGIRP43119 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTGIRP43119 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTGIRP43119 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTGIRP43119 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTGIRP43119 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTGIRP43119 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTGIRP43119 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTGIRP43119 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTGIRP43119 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTGIRP43119 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTGIRP43119 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTGIRP43119 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTGIRP43119 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTGIRP43119 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTGIRP43119 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTGIRP43119 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTGIRP43119 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTGIRP43119 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTGIRP43119 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTGIRP43119 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTGIRP43119 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTGIRP43119 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTGIRP43119 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTGIRP43119 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTGIRP43119 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTGIRP43119 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTGIRP43119 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTGIRP43119 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTGIRP43119 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTGIRP43119 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTGIRP43119 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTGIRP43119 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTGIRP43119 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTGIRP43119 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTGIRP43119 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTGIRP43119 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTGIRP43119 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTGIRP43119 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTGIRP43119 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTGIRP43119 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTGIRP43119 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTGIRP43119 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTGIRP43119 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTGIRP43119 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTGIRP43119 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTGIRP43119 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTGIRP43119 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTGIRP43119 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTGIRP43119 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTGIRP43119 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTGIRP43119 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTGIRP43119 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTGIRP43119 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTGIRP43119 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTGIRP43119 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTGIRP43119 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTGIRP43119 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTGIRP43119 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTGIRP43119 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTGIRP43119 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTGIRP43119 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTGIRP43119 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTGIRP43119 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTGIRP43119 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTGIRP43119 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTGIRP43119 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PTGIRP43119 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTGIRP43119 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTGIRP43119 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTGIRP43119 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTGIRP43119 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTGIRP43119 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTGIRP43119 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTGIRP43119 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTGIRP43119 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTGIRP43119 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTGIRP43119 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTGIRP43119 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTGIRP43119 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PTGIRP43119 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTGIRP43119 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTGIRP43119 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.1 ms