Protein–RNA interactions for Protein: P42338

PIK3CB, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,070 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CBP42338 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PIK3CBP42338 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PIK3CBP42338 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PIK3CBP42338 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PIK3CBP42338 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PIK3CBP42338 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PIK3CBP42338 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PIK3CBP42338 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PIK3CBP42338 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PIK3CBP42338 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PIK3CBP42338 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PIK3CBP42338 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PIK3CBP42338 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PIK3CBP42338 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PIK3CBP42338 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PIK3CBP42338 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PIK3CBP42338 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PIK3CBP42338 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PIK3CBP42338 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PIK3CBP42338 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PIK3CBP42338 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PIK3CBP42338 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PIK3CBP42338 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PIK3CBP42338 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PIK3CBP42338 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PIK3CBP42338 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PIK3CBP42338 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
PIK3CBP42338 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PIK3CBP42338 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PIK3CBP42338 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PIK3CBP42338 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PIK3CBP42338 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PIK3CBP42338 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PIK3CBP42338 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PIK3CBP42338 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PIK3CBP42338 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PIK3CBP42338 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PIK3CBP42338 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PIK3CBP42338 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PIK3CBP42338 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PIK3CBP42338 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
PIK3CBP42338 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
PIK3CBP42338 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PIK3CBP42338 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PIK3CBP42338 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PIK3CBP42338 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PIK3CBP42338 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PIK3CBP42338 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
PIK3CBP42338 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PIK3CBP42338 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PIK3CBP42338 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
PIK3CBP42338 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PIK3CBP42338 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PIK3CBP42338 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
PIK3CBP42338 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PIK3CBP42338 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PIK3CBP42338 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
PIK3CBP42338 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PIK3CBP42338 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PIK3CBP42338 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PIK3CBP42338 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PIK3CBP42338 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PIK3CBP42338 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PIK3CBP42338 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PIK3CBP42338 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PIK3CBP42338 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PIK3CBP42338 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PIK3CBP42338 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PIK3CBP42338 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PIK3CBP42338 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PIK3CBP42338 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PIK3CBP42338 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PIK3CBP42338 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PIK3CBP42338 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PIK3CBP42338 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PIK3CBP42338 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PIK3CBP42338 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PIK3CBP42338 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PIK3CBP42338 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PIK3CBP42338 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PIK3CBP42338 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PIK3CBP42338 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PIK3CBP42338 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PIK3CBP42338 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PIK3CBP42338 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PIK3CBP42338 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PIK3CBP42338 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PIK3CBP42338 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PIK3CBP42338 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PIK3CBP42338 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PIK3CBP42338 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PIK3CBP42338 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PIK3CBP42338 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PIK3CBP42338 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PIK3CBP42338 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
PIK3CBP42338 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PIK3CBP42338 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
PIK3CBP42338 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
PIK3CBP42338 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PIK3CBP42338 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms