Protein–RNA interactions for Protein: P40925

MDH1, Malate dehydrogenase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDH1P40925 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MDH1P40925 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
MDH1P40925 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MDH1P40925 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
MDH1P40925 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
MDH1P40925 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
MDH1P40925 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MDH1P40925 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
MDH1P40925 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
MDH1P40925 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MDH1P40925 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MDH1P40925 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MDH1P40925 AP4B1-201ENST00000256658 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MDH1P40925 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MDH1P40925 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MDH1P40925 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MDH1P40925 PDE8A-201ENST00000310298 3984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MDH1P40925 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MDH1P40925 CARHSP1-216ENST00000610831 2841 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MDH1P40925 DUSP28-202ENST00000405954 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MDH1P40925 TMPRSS6-201ENST00000346753 3197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MDH1P40925 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MDH1P40925 SAMD4B-201ENST00000314471 4519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MDH1P40925 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MDH1P40925 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MDH1P40925 RGS8-204ENST00000483095 1432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MDH1P40925 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MDH1P40925 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MDH1P40925 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MDH1P40925 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MDH1P40925 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MDH1P40925 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MDH1P40925 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MDH1P40925 AC027288.3-202ENST00000550268 1820 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MDH1P40925 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MDH1P40925 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MDH1P40925 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MDH1P40925 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MDH1P40925 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MDH1P40925 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MDH1P40925 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MDH1P40925 FLJ40288-201ENST00000332558 1998 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MDH1P40925 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MDH1P40925 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MDH1P40925 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MDH1P40925 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
MDH1P40925 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
MDH1P40925 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MDH1P40925 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
MDH1P40925 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MDH1P40925 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MDH1P40925 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MDH1P40925 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
MDH1P40925 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MDH1P40925 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MDH1P40925 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MDH1P40925 CARHSP1-220ENST00000619881 2849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MDH1P40925 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MDH1P40925 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MDH1P40925 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MDH1P40925 GORASP1-201ENST00000319283 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MDH1P40925 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MDH1P40925 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MDH1P40925 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MDH1P40925 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MDH1P40925 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MDH1P40925 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MDH1P40925 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MDH1P40925 FZD6-206ENST00000523739 2774 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
MDH1P40925 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
MDH1P40925 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
MDH1P40925 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
MDH1P40925 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
MDH1P40925 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
MDH1P40925 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
MDH1P40925 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
MDH1P40925 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
MDH1P40925 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
MDH1P40925 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MDH1P40925 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MDH1P40925 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MDH1P40925 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MDH1P40925 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MDH1P40925 PRAME-214ENST00000543184 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MDH1P40925 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MDH1P40925 SLC19A1-201ENST00000311124 3811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MDH1P40925 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MDH1P40925 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MDH1P40925 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MDH1P40925 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MDH1P40925 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MDH1P40925 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MDH1P40925 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
MDH1P40925 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MDH1P40925 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MDH1P40925 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
MDH1P40925 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
MDH1P40925 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MDH1P40925 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MDH1P40925 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.4 ms