Protein–RNA interactions for Protein: P35221

CTNNA1, Catenin alpha-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA1P35221 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTNNA1P35221 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTNNA1P35221 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTNNA1P35221 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTNNA1P35221 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTNNA1P35221 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTNNA1P35221 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTNNA1P35221 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTNNA1P35221 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTNNA1P35221 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTNNA1P35221 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CTNNA1P35221 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTNNA1P35221 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTNNA1P35221 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTNNA1P35221 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTNNA1P35221 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTNNA1P35221 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTNNA1P35221 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTNNA1P35221 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTNNA1P35221 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTNNA1P35221 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTNNA1P35221 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTNNA1P35221 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTNNA1P35221 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTNNA1P35221 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTNNA1P35221 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTNNA1P35221 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTNNA1P35221 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTNNA1P35221 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTNNA1P35221 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTNNA1P35221 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTNNA1P35221 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTNNA1P35221 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTNNA1P35221 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTNNA1P35221 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTNNA1P35221 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTNNA1P35221 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CTNNA1P35221 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTNNA1P35221 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTNNA1P35221 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTNNA1P35221 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTNNA1P35221 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CTNNA1P35221 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTNNA1P35221 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTNNA1P35221 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTNNA1P35221 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTNNA1P35221 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CTNNA1P35221 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTNNA1P35221 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTNNA1P35221 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTNNA1P35221 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTNNA1P35221 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTNNA1P35221 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTNNA1P35221 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTNNA1P35221 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTNNA1P35221 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTNNA1P35221 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTNNA1P35221 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTNNA1P35221 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTNNA1P35221 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTNNA1P35221 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTNNA1P35221 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTNNA1P35221 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTNNA1P35221 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTNNA1P35221 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTNNA1P35221 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTNNA1P35221 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTNNA1P35221 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTNNA1P35221 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTNNA1P35221 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTNNA1P35221 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTNNA1P35221 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTNNA1P35221 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTNNA1P35221 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTNNA1P35221 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTNNA1P35221 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTNNA1P35221 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTNNA1P35221 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTNNA1P35221 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTNNA1P35221 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTNNA1P35221 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTNNA1P35221 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTNNA1P35221 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CTNNA1P35221 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTNNA1P35221 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTNNA1P35221 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTNNA1P35221 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTNNA1P35221 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTNNA1P35221 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CTNNA1P35221 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CTNNA1P35221 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTNNA1P35221 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTNNA1P35221 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTNNA1P35221 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTNNA1P35221 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTNNA1P35221 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTNNA1P35221 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTNNA1P35221 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTNNA1P35221 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTNNA1P35221 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.3 ms