Protein–RNA interactions for Protein: P32246

CCR1, C-C chemokine receptor type 1, humanhuman

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR1P32246 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCR1P32246 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCR1P32246 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCR1P32246 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCR1P32246 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCR1P32246 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCR1P32246 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCR1P32246 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCR1P32246 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCR1P32246 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCR1P32246 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCR1P32246 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCR1P32246 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCR1P32246 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCR1P32246 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCR1P32246 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CCR1P32246 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
CCR1P32246 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCR1P32246 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCR1P32246 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CCR1P32246 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCR1P32246 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CCR1P32246 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCR1P32246 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCR1P32246 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCR1P32246 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCR1P32246 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CCR1P32246 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCR1P32246 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCR1P32246 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCR1P32246 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCR1P32246 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
CCR1P32246 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCR1P32246 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CCR1P32246 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CCR1P32246 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CCR1P32246 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCR1P32246 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CCR1P32246 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CCR1P32246 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CCR1P32246 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCR1P32246 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CCR1P32246 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCR1P32246 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCR1P32246 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCR1P32246 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCR1P32246 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCR1P32246 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CCR1P32246 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCR1P32246 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCR1P32246 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCR1P32246 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCR1P32246 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCR1P32246 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCR1P32246 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCR1P32246 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CCR1P32246 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCR1P32246 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCR1P32246 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCR1P32246 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CCR1P32246 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCR1P32246 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCR1P32246 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCR1P32246 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCR1P32246 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCR1P32246 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCR1P32246 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCR1P32246 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCR1P32246 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCR1P32246 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCR1P32246 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCR1P32246 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCR1P32246 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCR1P32246 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCR1P32246 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCR1P32246 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCR1P32246 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCR1P32246 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCR1P32246 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCR1P32246 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCR1P32246 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CCR1P32246 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCR1P32246 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCR1P32246 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCR1P32246 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CCR1P32246 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCR1P32246 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCR1P32246 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCR1P32246 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCR1P32246 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CCR1P32246 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCR1P32246 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCR1P32246 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCR1P32246 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CCR1P32246 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCR1P32246 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCR1P32246 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCR1P32246 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CCR1P32246 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CCR1P32246 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.9 ms