Protein–RNA interactions for Protein: P24723

PRKCH, Protein kinase C eta type, humanhuman

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Length 683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCHP24723 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRKCHP24723 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRKCHP24723 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRKCHP24723 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRKCHP24723 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRKCHP24723 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRKCHP24723 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRKCHP24723 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PRKCHP24723 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRKCHP24723 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRKCHP24723 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRKCHP24723 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRKCHP24723 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRKCHP24723 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRKCHP24723 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRKCHP24723 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRKCHP24723 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRKCHP24723 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRKCHP24723 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRKCHP24723 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRKCHP24723 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRKCHP24723 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRKCHP24723 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRKCHP24723 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRKCHP24723 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRKCHP24723 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PRKCHP24723 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PRKCHP24723 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRKCHP24723 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRKCHP24723 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PRKCHP24723 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRKCHP24723 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRKCHP24723 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PRKCHP24723 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PRKCHP24723 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRKCHP24723 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PRKCHP24723 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PRKCHP24723 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PRKCHP24723 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PRKCHP24723 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PRKCHP24723 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PRKCHP24723 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PRKCHP24723 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PRKCHP24723 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PRKCHP24723 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PRKCHP24723 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PRKCHP24723 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PRKCHP24723 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PRKCHP24723 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
PRKCHP24723 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PRKCHP24723 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PRKCHP24723 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PRKCHP24723 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRKCHP24723 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRKCHP24723 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRKCHP24723 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRKCHP24723 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRKCHP24723 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRKCHP24723 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRKCHP24723 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRKCHP24723 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PRKCHP24723 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PRKCHP24723 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRKCHP24723 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRKCHP24723 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRKCHP24723 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRKCHP24723 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRKCHP24723 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRKCHP24723 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PRKCHP24723 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PRKCHP24723 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRKCHP24723 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRKCHP24723 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PRKCHP24723 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRKCHP24723 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PRKCHP24723 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PRKCHP24723 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRKCHP24723 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRKCHP24723 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRKCHP24723 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRKCHP24723 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRKCHP24723 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRKCHP24723 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRKCHP24723 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRKCHP24723 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRKCHP24723 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRKCHP24723 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRKCHP24723 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRKCHP24723 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRKCHP24723 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRKCHP24723 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRKCHP24723 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRKCHP24723 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRKCHP24723 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PRKCHP24723 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PRKCHP24723 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PRKCHP24723 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PRKCHP24723 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRKCHP24723 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRKCHP24723 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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