Protein–RNA interactions for Protein: P23443

RPS6KB1, Ribosomal protein S6 kinase beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KB1P23443 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPS6KB1P23443 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPS6KB1P23443 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPS6KB1P23443 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPS6KB1P23443 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPS6KB1P23443 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPS6KB1P23443 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPS6KB1P23443 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPS6KB1P23443 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPS6KB1P23443 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPS6KB1P23443 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPS6KB1P23443 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
RPS6KB1P23443 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPS6KB1P23443 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPS6KB1P23443 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPS6KB1P23443 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPS6KB1P23443 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
RPS6KB1P23443 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPS6KB1P23443 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPS6KB1P23443 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPS6KB1P23443 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPS6KB1P23443 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPS6KB1P23443 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPS6KB1P23443 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPS6KB1P23443 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPS6KB1P23443 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPS6KB1P23443 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPS6KB1P23443 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
RPS6KB1P23443 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
RPS6KB1P23443 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPS6KB1P23443 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPS6KB1P23443 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPS6KB1P23443 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPS6KB1P23443 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPS6KB1P23443 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPS6KB1P23443 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPS6KB1P23443 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPS6KB1P23443 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPS6KB1P23443 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPS6KB1P23443 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPS6KB1P23443 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPS6KB1P23443 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPS6KB1P23443 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPS6KB1P23443 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPS6KB1P23443 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPS6KB1P23443 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPS6KB1P23443 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPS6KB1P23443 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPS6KB1P23443 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPS6KB1P23443 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPS6KB1P23443 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPS6KB1P23443 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
RPS6KB1P23443 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPS6KB1P23443 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
RPS6KB1P23443 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPS6KB1P23443 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPS6KB1P23443 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPS6KB1P23443 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPS6KB1P23443 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPS6KB1P23443 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPS6KB1P23443 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPS6KB1P23443 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPS6KB1P23443 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPS6KB1P23443 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPS6KB1P23443 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPS6KB1P23443 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPS6KB1P23443 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPS6KB1P23443 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPS6KB1P23443 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPS6KB1P23443 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPS6KB1P23443 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPS6KB1P23443 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPS6KB1P23443 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPS6KB1P23443 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPS6KB1P23443 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPS6KB1P23443 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPS6KB1P23443 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPS6KB1P23443 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPS6KB1P23443 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPS6KB1P23443 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPS6KB1P23443 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPS6KB1P23443 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPS6KB1P23443 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPS6KB1P23443 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPS6KB1P23443 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPS6KB1P23443 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPS6KB1P23443 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPS6KB1P23443 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPS6KB1P23443 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPS6KB1P23443 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPS6KB1P23443 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPS6KB1P23443 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
RPS6KB1P23443 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
RPS6KB1P23443 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPS6KB1P23443 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPS6KB1P23443 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
RPS6KB1P23443 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPS6KB1P23443 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
RPS6KB1P23443 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPS6KB1P23443 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms