Protein–RNA interactions for Protein: P19429

TNNI3, Troponin I, cardiac muscle, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI3P19429 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TNNI3P19429 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TNNI3P19429 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TNNI3P19429 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TNNI3P19429 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TNNI3P19429 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TNNI3P19429 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TNNI3P19429 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TNNI3P19429 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TNNI3P19429 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TNNI3P19429 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TNNI3P19429 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TNNI3P19429 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
TNNI3P19429 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TNNI3P19429 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TNNI3P19429 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
TNNI3P19429 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TNNI3P19429 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TNNI3P19429 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TNNI3P19429 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TNNI3P19429 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
TNNI3P19429 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TNNI3P19429 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TNNI3P19429 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TNNI3P19429 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TNNI3P19429 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TNNI3P19429 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TNNI3P19429 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TNNI3P19429 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TNNI3P19429 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TNNI3P19429 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TNNI3P19429 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TNNI3P19429 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TNNI3P19429 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TNNI3P19429 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TNNI3P19429 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TNNI3P19429 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TNNI3P19429 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TNNI3P19429 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TNNI3P19429 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TNNI3P19429 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TNNI3P19429 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TNNI3P19429 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TNNI3P19429 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
TNNI3P19429 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TNNI3P19429 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TNNI3P19429 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TNNI3P19429 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TNNI3P19429 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TNNI3P19429 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TNNI3P19429 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TNNI3P19429 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TNNI3P19429 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TNNI3P19429 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TNNI3P19429 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TNNI3P19429 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TNNI3P19429 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TNNI3P19429 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TNNI3P19429 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TNNI3P19429 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TNNI3P19429 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TNNI3P19429 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
TNNI3P19429 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
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TNNI3P19429 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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TNNI3P19429 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.82□□□□□ -0.04
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TNNI3P19429 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TNNI3P19429 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TNNI3P19429 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TNNI3P19429 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TNNI3P19429 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TNNI3P19429 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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TNNI3P19429 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TNNI3P19429 AC097374.1-201ENST00000568768 6624 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TNNI3P19429 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TNNI3P19429 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TNNI3P19429 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TNNI3P19429 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TNNI3P19429 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TNNI3P19429 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TNNI3P19429 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
TNNI3P19429 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TNNI3P19429 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TNNI3P19429 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TNNI3P19429 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TNNI3P19429 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TNNI3P19429 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TNNI3P19429 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TNNI3P19429 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TNNI3P19429 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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